RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF521Q96K83 1311 aa20.78■□□□□ 0.92
SLC20A1-201ENST00000272542 SLFN5Q08AF3 891 aa20.77■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.77■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.76■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 PIK3C2BO00750 1634 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 GLI2P10070 1586 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 CABP1Q9NZU7 370 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.75■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.74■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 DIP2BQ9P265 1576 aa20.74■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 CDK19Q9BWU1 502 aa20.74■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.911e-9■■■□□ 17
SLC20A1-201ENST00000272542 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.73■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.73■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 TULP4Q9NRJ4 1543 aa20.72■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 WWC1Q8IX03 1113 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 A0A1W2PP64 1363 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.71■□□□□ 0.91
SLC20A1-201ENST00000272542 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.7■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 NUTM2FA1L443 756 aa20.7■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 FYB1O15117 783 aa20.68■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.66■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 INSRP06213 1382 aa20.64■□□□□ 0.9
SLC20A1-201ENST00000272542 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.64■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 RUNDC1Q96C34 613 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 CFAP53Q96M91 514 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 TNNQ9UQP3 1299 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 E9PSI1 815 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 ZMYM3Q14202 1370 aa20.63■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 PTPRMP28827 1452 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 PANK1Q8TE04 598 aa20.62■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.61■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 METP08581 1390 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.6■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 ZFYVE9O95405 1425 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 ALKQ9UM73 1620 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 COG6Q9Y2V7 657 aa20.58■□□□□ 0.89
SLC20A1-201ENST00000272542 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.57■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 RGS3P49796 1198 aa20.55■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 PDE4AP27815 886 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 NME9Q86XW9 330 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC11Q96J66 1382 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 HMOX1P09601 288 aa20.54■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.53■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 SOX12O15370 315 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 LTKP29376 864 aa20.52■□□□□ 0.88
SLC20A1-201ENST00000272542 RLBP1P12271 317 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 SHPRHQ149N8 1683 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 IGHDP01880 384 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 POLKQ9UBT6 870 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 RIPK4P57078 832 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC20A1-201ENST00000272542 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms