RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GPBP1-201ENST00000264779 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
GPBP1-201ENST00000264779 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.41□□□□□ -1.22
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.41□□□□□ -1.22
GPBP1-201ENST00000264779 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.4□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 C6orf229H3BNL8 230 aa7.39□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 SPRYD7Q5W111 196 aa7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 GFRA3O60609 400 aa7.37□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 MMP16P51512 607 aa7.37□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 RETREG3Q86VR2 466 aa7.37□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.36□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.35□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.35□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.35□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 JUNDP17535 347 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 MTMR2Q13614 643 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 Q6ZNB5 142 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.34□□□□□ -1.23
GPBP1-201ENST00000264779 SPTLC1O15269 473 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 TNFRSF10AO00220 468 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 GJA5P36382 358 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 RPIAP49247 311 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 LAPTM4AQ15012 233 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR7Q8TB68 274 aa7.33□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.32□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 FOXC1Q12948 553 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 FAM117AQ9C073 453 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 HRCP23327 699 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.31□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM32Q13049 653 aa7.3□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.3□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP99D6REC4 459 aa7.29□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 QPCTQ16769 361 aa7.29□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.29□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 GDF9O60383 454 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NEUROD2Q15784 382 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR20EP86478 221 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR20CP86479 221 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR20DP86480 221 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR20BP86481 221 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRR20AP86496 221 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 TSC1Q92574 1164 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.28□□□□□ -1.24
GPBP1-201ENST00000264779 PTPRNQ16849 979 aa7.27□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 DESI1Q6ICB0 168 aa7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 LILRB3O75022 631 aa7.25□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 LCE2BO14633 110 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 PKDCCQ504Y2 493 aa7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 FAM187AA6NFU0 413 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 CTHP32929 405 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 LYPD8Q6UX82 237 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 WNT7AO00755 349 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 SKOR1P84550 965 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 CYP4X1Q8N118 509 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.23□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 KCNH2Q12809 1159 aa7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 WNT7BP56706 349 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 LINC01559Q495D7 138 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 MAP10Q9P2G4 905 aa7.21□□□□□ -1.25
GPBP1-201ENST00000264779 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GPBP1-201ENST00000264779 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.5 ms