RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 KDM4AO75164 1064 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 MIA2Q96PC5 1412 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 NRDCO43847 1150 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 FBXW7Q969H0 707 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 TIAM1Q13009 1591 aa6.78□□□□□ -1.32
LMO3-201ENST00000261169 SLC4A2P04920 1241 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MPNDQ8N594 471 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 DAPK1P53355 1430 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RNF214Q8ND24 703 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 BACH2Q9BYV9 841 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SYNJ2O15056 1496 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MSH5O43196 834 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CLSTN1O94985 981 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 APPP05067 770 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ARHGEF11O15085 1522 aa6.77□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CUL7Q14999 1698 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 REC8O95072 547 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 WWC1Q8IX03 1113 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 H3BQV1 296 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 IFFO2Q5TF58 517 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 IL27Q8NEV9 243 aa6.76□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NEK4P51957 841 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PDE4CQ08493 712 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 IDI1Q13907 227 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CCDC27Q2M243 656 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 STAC3Q96MF2 364 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SIL1Q9H173 461 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ERBINQ96RT1 1412 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PDE3AQ14432 1141 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MCM10Q7L590 875 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 STRN4Q9NRL3 753 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ABCC5O15440 1437 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SLFN5Q08AF3 891 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 TMEM57Q8N5G2 664 aa6.74□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PTPRKQ15262 1439 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 RAD21O60216 631 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ATF3P18847 181 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 NME9Q86XW9 330 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MTMR7Q9Y216 660 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa6.73□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 MYL6BP14649 208 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 BICD2Q8TD16 824 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 BECN2A8MW95 431 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 F6X3S4 739 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 G3V3G9 751 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 TRAK2O60296 914 aa6.72□□□□□ -1.33
LMO3-201ENST00000261169 CDC45O75419 566 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms