RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ROCK1Q13464 1354 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CLCN1P35523 988 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 SDF4Q9BRK5 362 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 PDE3AQ14432 1141 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 SMC2O95347 1197 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CCDC27Q2M243 656 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 EID1Q9Y6B2 187 aa19.28■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 NEK4P51957 841 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CAGE1Q8TC20 777 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 RUNDC1Q96C34 613 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 TOMM22Q9NS69 142 aa19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 TRIM29Q14134 588 aa19.27■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 FIBPO43427 364 aa19.26■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 DYNC1I1O14576 645 aa19.26■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 OLFM4Q6UX06 510 aa19.26■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 ERLIN1O75477 346 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 CPLX1O14810 134 aa19.25■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.23■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 KINO60870 393 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.23■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 OSCARQ8IYS5 282 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa19.22■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 GIMAP7Q8NHV1 300 aa19.21■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
CTIF-201ENST00000256413 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 MCM5P33992 734 aa19.2■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 RIPK4P57078 832 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 SYCE3A1L190 88 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 PDCP20941 246 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 FOSBP53539 338 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 UBXN4Q92575 508 aa19.19■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 FMNL2Q96PY5 1086 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 TNMDQ9H2S6 317 aa19.18■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 MARCH6O60337 910 aa19.17■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 TIGD1Q96MW7 591 aa19.17■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.17■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 UACAQ9BZF9 1416 aa19.16■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 GCC1Q96CN9 775 aa19.16■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.16■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 SMARCE1Q969G3 411 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 BCAR3O75815 825 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 PSMA5P28066 241 aa19.15■□□□□ 0.66
CTIF-201ENST00000256413 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 SPDYE4A6NLX3 237 aa19.14■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 CCDC102AQ96A19 550 aa19.14■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 CCDC184Q52MB2 194 aa19.14■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GPATCH11Q8N954 259 aa19.14■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 ERC2O15083 957 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 PRIMPOLQ96LW4 560 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.13■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.12■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 PTPN14Q15678 1187 aa19.12■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 23.6
CTIF-201ENST00000256413 CENPHQ9H3R5 247 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 SERPINC1P01008 464 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.11■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 KRT85P78386 507 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GNAI1P63096 354 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 MIA2Q96PC5 1412 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L10A6NI86 522 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.1■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.09■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.09■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 MYO6Q9UM54 1294 aa19.09■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 KIF18AQ8NI77 898 aa19.09■□□□□ 0.65
CTIF-201ENST00000256413 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms