RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 ORAI2Q96SN7 254 aa30.62■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.62■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.6■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 LAMC1P11047 1609 aa30.59■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 MYOM2P54296 1465 aa30.58■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.57■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 C8orf37Q96NL8 207 aa30.57■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.57■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 ABCC11Q96J66 1382 aa30.55■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.54■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.52■■■□□ 2.48
CITED1-201ENST00000246139 TECPR2O15040 1411 aa30.51■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 ADAMTS2O95450 1211 aa30.51■■■□□ 2.47
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CITED1-201ENST00000246139 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.49■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 NUTM2FA1L443 756 aa30.48■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.48■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 RGS12O14924 1447 aa30.47■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 SIRT1Q96EB6 747 aa30.46■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 STAC3Q96MF2 364 aa30.46■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 NGLY1Q96IV0 654 aa30.45■■■□□ 2.47
CITED1-201ENST00000246139 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.43■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.43■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.42■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 PRAM1Q96QH2 718 aa30.41■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 POGKQ9P215 609 aa30.41■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
CITED1-201ENST00000246139 PXDNQ92626 1479 aa30.38■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 FOXO3O43524 673 aa30.37■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.37■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.37■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 USP21Q9UK80 565 aa30.35■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 ADGRB1O14514 1584 aa30.33■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CITED1-201ENST00000246139 DLC1Q96QB1 1528 aa30.3■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 ATRNO75882 1429 aa30.29■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.28■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 EP400Q96L91 3159 aa30.28■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CITED1-201ENST00000246139 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.25■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa30.25■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.24■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.24■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.22■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 NEUROD1Q13562 356 aa30.2■■■□□ 2.43
CITED1-201ENST00000246139 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.18■■■□□ 2.42
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CITED1-201ENST00000246139 PSME1Q06323 249 aa30.17■■■□□ 2.42
CITED1-201ENST00000246139 KIF1AQ12756 1690 aa30.17■■■□□ 2.42
CITED1-201ENST00000246139 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30.16■■■□□ 2.42
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CITED1-201ENST00000246139 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.12■■■□□ 2.41
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CITED1-201ENST00000246139 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.11■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.11■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
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CITED1-201ENST00000246139 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 SLIT2O94813 1529 aa30.1■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 GLI3P10071 1580 aa30.08■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CITED1-201ENST00000246139 USP32Q8NFA0 1604 aa30.07■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.07■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.07■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.05■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.05■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.05■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 SBNO1A3KN83 1393 aa30.03■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 CDK19Q9BWU1 502 aa30.02■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.02■■■□□ 2.4
CITED1-201ENST00000246139 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 ABCA3Q99758 1704 aa30.01■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.01■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 BRWD3Q6RI45 1802 aa30.01■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF10O15013 1369 aa29.98■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.98■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CITED1-201ENST00000246139 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 CCDC125Q86Z20 511 aa29.93■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.92■■■□□ 2.38
CITED1-201ENST00000246139 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.92■■■□□ 2.38
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