RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.1■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 PRAM1Q96QH2 718 aa32.09■■■□□ 2.73
SYF2-201ENST00000236273 TONSLQ96HA7 1378 aa32.07■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 CLSPNQ9HAW4 1339 aa32.07■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.04■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa32.02■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 BRINP3Q76B58 766 aa32.01■■■□□ 2.72
SYF2-201ENST00000236273 C1orf167Q5SNV9 1468 aa32.01■■■□□ 2.71
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
SYF2-201ENST00000236273 POGKQ9P215 609 aa32■■■□□ 2.71
SYF2-201ENST00000236273 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 ORAI2Q96SN7 254 aa31.94■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.92■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.92■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 ADGRB2O60241 1585 aa31.91■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2FA1L443 756 aa31.89■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.89■■■□□ 2.7
SYF2-201ENST00000236273 PHLPP1O60346 1717 aa31.88■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.86■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.85■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
SYF2-201ENST00000236273 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.82■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 USP32Q8NFA0 1604 aa31.82■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 PRR36Q9H6K5 1346 aa31.79■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.78■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.76■■■□□ 2.68
SYF2-201ENST00000236273 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.74■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.74■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 CDK19Q9BWU1 502 aa31.74■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 FOXO3O43524 673 aa31.73■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.71■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 JCADQ9P266 1359 aa31.7■■■□□ 2.67
SYF2-201ENST00000236273 PXDNQ92626 1479 aa31.68■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 KIF1AQ12756 1690 aa31.68■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.68■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 ATP7BP35670 1465 aa31.67■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.65■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
SYF2-201ENST00000236273 SHPRHQ149N8 1683 aa31.64■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 CABP2Q9NPB3 220 aa31.62■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.6■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.6■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.59■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa31.58■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 CCDC61Q9Y6R9 512 aa31.58■■■□□ 2.65
SYF2-201ENST00000236273 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 EVC2Q86UK5 1308 aa31.57■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.56■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 TESK2Q96S53 571 aa31.56■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 ITSN1Q15811 1721 aa31.56■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.56■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG3A1L390 1219 aa31.55■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 LRP6O75581 1613 aa31.54■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.53■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 PSME1Q06323 249 aa31.52■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 USP47Q96K76 1375 aa31.52■■■□□ 2.64
SYF2-201ENST00000236273 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.5■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 SBNO1A3KN83 1393 aa31.49■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.49■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 ACEP12821 1306 aa31.48■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 CABP1Q9NZU7 370 aa31.48■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.45■■■□□ 2.63
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 ALS2Q96Q42 1657 aa31.4■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.39■■■□□ 2.62
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF10O15013 1369 aa31.35■■■□□ 2.61
SYF2-201ENST00000236273 SLC24A1O60721 1099 aa31.34■■■□□ 2.61
SYF2-201ENST00000236273 LMOD2Q6P5Q4 547 aa31.33■■■□□ 2.61
SYF2-201ENST00000236273 CABLES1Q8TDN4 633 aa31.33■■■□□ 2.61
SYF2-201ENST00000236273 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
SYF2-201ENST00000236273 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 SSH2Q76I76 1423 aa31.32■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS2O95450 1211 aa31.31■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 CD163L1Q9NR16 1453 aa31.31■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 USP6P35125 1406 aa31.31■■■□□ 2.6
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms