RNA–Protein interactions for RNA: YOL076W

MDM20, Transcript of Non-catalytic subunit of the NatB N-terminal acetyltransferase, yeast

Gene MDM20, Length 2,391 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM20	YOL076W	RPC10	P40422	70 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	AIM19	P40502	157 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YOR072W	Q08486	104 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YAR064W	P39563	99 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YMR103C	Q04436	120 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	HPA2	Q06592	156 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		0.89	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	0.88	□□□□□ -2.27	not detected
MDM20	YOL076W	CYB5	P40312	120 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	UBC4	P15731	148 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YMR007W	Q03675	126 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	SEN15	Q04675	128 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	ENV10	Q99382	181 aa		0.88	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	ECM12	O13529	151 aa		0.87	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YHR130C	P38834	111 aa		0.87	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	RRT15	Q3E811	62 aa		0.87	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YIL102C	P40488	101 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	ICS3	P47034	131 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	SNN1	P48232	102 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YOR105W	Q08504	108 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	COA6	Q3E846	104 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	SNA2	P56508	79 aa		0.86	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.85	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YMR141C	P40211	102 aa		0.85	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	YIL163C	P40448	117 aa		0.85	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	PAU4	P53427	120 aa		0.84	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.84	□□□□□ -2.27
MDM20	YOL076W	AQY2	P0CD90	149 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU1	P0CE88	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU14	P0CE89	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU6	P0CE90	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU18	P0CE91	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU8	P0CE92	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU11	P0CE93	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	HMRA1	P0CY11	126 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU13	P38725	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	COX23	P38824	151 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU7	P39545	55 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU5	P43575	122 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU10	Q03050	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU20	Q08322	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU9	Q3E770	120 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		0.84	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU19	P0CE85	124 aa		0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU3	P25610	124 aa		0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YHL005C	P38752	130 aa		0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	MGR2	Q02889	113 aa		0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	COX19	Q3E731	98 aa		0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YAL065C	O13511	128 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	SRB6	P32570	121 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	HUA1	P40325	198 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	TOS6	P48560	102 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.82	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU16	P35994	123 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	PAU15	P40585	124 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	CWP2	P43497	92 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YNL190W	P53872	204 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.81	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.8	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	MVB12	P42939	101 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	HMRA2	P0CY13	119 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MDM20	YOL076W	SHU1	P38751	150 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	COX7	P10174	60 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	DDR2	P89113	61 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	MRPS12	P53732	153 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	RSM18	P40033	138 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	HHY1	P39982	102 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MDM20	YOL076W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.75	□□□□□ -2.29

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