RNA–Protein interactions for RNA: YKR005C

YKR005C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR005C, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CYKR005C RPL38P49167 78 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C YLR361C-AQ3E795 98 aa7.25□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C FYV5P25585 152 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C TDA2P40045 126 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C YER187WP40102 141 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C SPC1P46965 94 aa7.22□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C DIF1O13577 133 aa7.21□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C YDR115WQ04598 105 aa7.21□□□□□ -1.25
YKR005CYKR005C YBR230W-AQ3E762 66 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C SFT1P43682 97 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C YKL183C-AQ3E765 70 aa7.2□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C STF1P01098 86 aa7.19□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C RSM18P40033 138 aa7.19□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C IGD1P43598 195 aa7.19□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C YDR246W-AQ3E763 66 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C YJL127C-BQ3E828 52 aa7.18□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C ATP20Q12233 115 aa7.17□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C ICS3P47034 131 aa7.16□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C YLR307C-AQ3E825 87 aa7.16□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa7.16□□□□□ -1.26
YKR005CYKR005C RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YCR050CP25630 102 aa7.15□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C RTC6O14464 93 aa7.13□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YER039C-AP0CD97 72 aa7.13□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C BET1P22804 142 aa7.13□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C COX23P38824 151 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data7.12□□□□□ -1.27not detected
YKR005CYKR005C RRT15Q3E811 62 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C Q0032Q9ZZX7 96 aa7.12□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YOR314WQ12506 109 aa7.11□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YCL042WP25572 119 aa7.1□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YHR213W-BQ8TGK1 99 aa7.1□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YOL014WQ08110 124 aa7.09□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
YKR005CYKR005C YAR023CD6VPM8 179 aa7.08□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C SNA2P56508 79 aa7.08□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C YJL133C-AQ3E7A3 74 aa7.04□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C SBH1P52870 82 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C YGL041C-BQ3E750 60 aa7.03□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
YKR005CYKR005C YDR182W-AQ3E796 67 aa7.01□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C ECM19Q06011 112 aa6.99□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C TDA8Q6B2U8 126 aa6.99□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C DDR2P89113 61 aa6.97□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C YLR122CQ12312 125 aa6.97□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C YGL193CP53097 103 aa6.96□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C BSC4P53841 131 aa6.96□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C YHR007C-AQ07074 71 aa6.96□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa6.96□□□□□ -1.29
YKR005CYKR005C YOR072WQ08486 104 aa6.95□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C PEX22P39718 180 aa6.94□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C AUA1P32450 94 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C YEL045CP32616 141 aa6.93□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C HOT13P36078 116 aa6.92□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data6.92□□□□□ -1.3not detected
YKR005CYKR005C YLR162WQ06235 118 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C MIC10Q96VH5 97 aa6.91□□□□□ -1.3
YKR005CYKR005C YIL102CP40488 101 aa6.9□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C LIP1Q03579 150 aa6.9□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C KTI11Q3E840 82 aa6.9□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C YHL005CP38752 130 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa6.88□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C KSH1Q8TGJ3 72 aa6.87□□□□□ -1.31
YKR005CYKR005C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YBR121C-AP0C5L4 52 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YGR164WP53291 111 aa6.82□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YJL197C-AP0C5P0 93 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YGR121W-AQ3E816 71 aa6.81□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YAR064WP39563 99 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YLR412C-AQ3E742 68 aa6.79□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C MRP10O75012 95 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YDR034C-AP0C289 58 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa6.78□□□□□ -1.32
YKR005CYKR005C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C YOR381W-AQ3E804 55 aa6.74□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C DYN1P36022 4092 aa6.73□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C YCR043CP25361 127 aa6.72□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C YOR268CQ08734 132 aa6.72□□□□□ -1.33
YKR005CYKR005C YPR195CQ06594 109 aa6.71□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YKL065W-AQ2V2P2 73 aa6.7□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C SPG1P50088 95 aa6.69□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YBR027CP38220 110 aa6.68□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YPR153WQ06537 140 aa6.67□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YLR157W-DP0CE99 70 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YHR125WP38831 101 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YMR122CQ03879 124 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa6.66□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C SDH6Q3E785 79 aa6.65□□□□□ -1.34
YKR005CYKR005C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
YKR005CYKR005C YDL012CQ12489 107 aa6.61□□□□□ -1.35
YKR005CYKR005C HHF1P02309 103 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.3 ms