RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	YAR1	P46683	200 aa		5.65	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	BET1	P22804	142 aa		5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	PEX22	P39718	180 aa		5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	YHL042W	P38729	150 aa		5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	GAT4	P40569	121 aa		5.62	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	MRP10	O75012	95 aa		5.6	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		5.6	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	YGL193C	P53097	103 aa		5.59	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	YNL184C	P53876	108 aa		5.59	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.51
GGA2	YHR108W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YLR156W	P0CE96	114 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YLR159W	P0CE97	114 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YLR161W	P0CE98	114 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YGR039W	P53225	103 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YPR195C	Q06594	109 aa		5.58	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	TDA2	P40045	126 aa		5.57	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	DDR2	P89113	61 aa		5.57	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YSY6	P38374	65 aa		5.57	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	SHH4	Q06236	168 aa		5.57	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	ICS3	P47034	131 aa		5.55	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		5.55	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	BSC4	P53841	131 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		5.53	□□□□□ -1.52
GGA2	YHR108W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	YOR072W	Q08486	104 aa		5.52	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	COX23	P38824	151 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	RSM18	P40033	138 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	ATP20	Q12233	115 aa		5.5	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.5	□□□□□ -1.53	not detected
GGA2	YHR108W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		5.5	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		5.49	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		5.48	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		5.47	□□□□□ -1.53
GGA2	YHR108W	YOL014W	Q08110	124 aa		5.46	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		5.46	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YOR304C-A	O14468	76 aa		5.45	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	ECM19	Q06011	112 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	LCL2	Q08045	131 aa		5.42	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YCR050C	P25630	102 aa		5.42	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	LCL1	Q02786	101 aa		5.42	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	SPG1	P50088	95 aa		5.41	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YLR162W	Q06235	118 aa		5.41	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	TOM6	P33448	61 aa		5.4	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.4	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	MIC10	Q96VH5	97 aa		5.4	□□□□□ -1.54
GGA2	YHR108W	YEL045C	P32616	141 aa		5.39	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YOR314W	Q12506	109 aa		5.39	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		5.38	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YLR415C	O13578	112 aa		5.37	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YER187W	P40102	141 aa		5.35	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		5.34	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	HOT13	P36078	116 aa		5.34	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	MMS2	P53152	137 aa		5.34	□□□□□ -1.55
GGA2	YHR108W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		5.33	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YBR027C	P38220	110 aa		5.32	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		5.31	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YPL080C	Q02826	108 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YOR268C	Q08734	132 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YAR064W	P39563	99 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GGA2	YHR108W	YCR043C	P25361	127 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	YIL102C	P40488	101 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		5.26	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	YGL149W	P53116	101 aa		5.25	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	LIP1	Q03579	150 aa		5.24	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
GGA2	YHR108W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
GGA2	YHR108W	YPR153W	Q06537	140 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GGA2	YHR108W	YDL012C	Q12489	107 aa		5.15	□□□□□ -1.58
GGA2	YHR108W	YHL005C	P38752	130 aa		5.14	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		5.14	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	KTI11	Q3E840	82 aa		5.13	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	YKL069W	P36088	180 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		5.09	□□□□□ -1.59
GGA2	YHR108W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
GGA2	YHR108W	YHR125W	P38831	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GGA2	YHR108W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GGA2	YHR108W	YFL067W	P43537	175 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GGA2	YHR108W	SDH6	Q3E785	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GGA2	YHR108W	COX7	P10174	60 aa		5.03	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.1 ms