RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC14Q49A88 953 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ARMCX2Q7L311 632 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 RNF157Q96PX1 679 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 RBP5P82980 135 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP11AP98196 1134 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PMF1Q6P1K2 205 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PLD5Q8N7P1 536 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MROH8Q9H579 483 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MCM8Q9UJA3 840 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 H7C0C1 242 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PRPSAP2O60256 369 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TSHRP16473 764 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP5OP48047 213 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 SETDB1Q15047 1291 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ACCSLQ4AC99 568 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PQLC3Q8N755 202 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 CYTH2Q99418 400 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 NT5C1AQ9BXI3 368 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 C2CD2Q9Y426 696 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KBTBD13C9JR72 458 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TSPAN1O60635 241 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 GABBR2O75899 941 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF286BP0CG31 522 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 T-ENOLP0DO92 83 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TFDP2Q14188 446 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 VSIG1Q86XK7 387 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 SERAC1Q96JX3 654 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ACAP3Q96P50 834 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 NME7Q9Y5B8 376 aa16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ASB14A6NK59 587 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PPIL2Q13356 520 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 LAMC2Q13753 1193 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 CA9Q16790 459 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TTC30AQ86WT1 665 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 AFG1LQ8WV93 481 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 FAF2Q96CS3 445 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 A0A1B0GUA9 196 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MAP3K6O95382 1288 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 OSBPP22059 807 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MAP2K2P36507 400 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 FAAP100Q0VG06 881 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KRT81Q14533 505 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PKDCCQ504Y2 493 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 NLRP7Q8WX94 980 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PTPRN2Q92932 1015 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 OPTNQ96CV9 577 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KIF12Q96FN5 646 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM237Q96Q45 408 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 HAO1Q9UJM8 370 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 PPEF2O14830 753 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 TM9SF1O15321 606 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 CHADO15335 359 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 KCNN4O15554 427 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 C1QAP02745 245 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 MT-ND3P03897 115 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 RBL1P28749 1068 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 ALDH3A1P30838 453 aa16.22■□□□□ 0.19
ANKRD54-210ENST00000498417 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms