RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	CXCR5	P32302	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ALDH9A1	P49189	494 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	MTHFS	P49914	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	GATM	P50440	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	COPA	P53621	1224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	GRM1	Q13255	1194 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	MORC3	Q14149	939 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SLC9A6	Q92581	669 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	USP22	Q9UPT9	525 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ORC4	O43929	436 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	RHOBTB3	O94955	611 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	JUP	P14923	745 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFB7	P17568	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ENG	P17813	658 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PCSK6	P29122	969 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CYP2C18	P33260	490 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	TEC	P42680	631 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SNX27	Q96L92	541 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	GDF15	Q99988	308 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334		F5H423	210 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	AP4M1	O00189	453 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PSMD9	O00233	223 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	EXOC5	O00471	708 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	KCNQ3	O43525	872 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	PLA2G6	O60733	806 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SNX2	O60749	519 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	COQ9	O75208	318 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ONECUT2	O95948	504 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	IDE	P14735	1019 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	BMP5	P22003	454 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	RARRES1	P49788	294 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	TPTE	P56180	551 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6	2e-6	■□□□□ 10.5
RBM39-231	ENST00000477334	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	STARD3	Q14849	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	GGT6	Q6P531	493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	MUL1	Q969V5	352 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	CRB3	Q9BUF7	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTS3	O15072	1205 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	AR	P10275	920 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	EGR1	P18146	543 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	MST1	P26927	711 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TIRAP	P58753	221 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	GPS1	Q13098	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	CYP1B1	Q16678	543 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM39-231	ENST00000477334	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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