RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C KRE1P17260 313 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL44P19956 98 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL33P20084 86 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YCR007CP25354 239 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SCM4P32564 187 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C UGX2P32772 223 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C HOT13P36078 116 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM29P36154 155 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C OXA1P39952 402 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C EDC2P40023 145 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.42□□□□□ -2.34not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C YER085CP40058 173 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C HAC1P41546 238 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MVB12P42939 101 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YFL019CP43576 117 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR085CP47131 105 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL088WP53151 121 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C AIM11P87275 137 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C ICY1Q04329 127 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SEN15Q04675 128 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YLR296WQ05898 108 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C HPA2Q06592 156 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MHR1Q06630 226 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C WIP1Q2V2P8 89 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YBL112CQ3E7Y4 105 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR121W-AQ3E816 71 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR020W-AQ3E824 90 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C IGO2Q9P305 131 aa0.42□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C ATP5P09457 212 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YER039C-AP0CD97 72 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C HAP3P13434 144 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C CDC43P18898 376 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C FYV5P25585 152 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C DUT1P33317 147 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SSS1P35179 80 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR209WP38311 105 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YIA6P40556 373 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SFT1P43682 97 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SPG1P50088 95 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C KNH1P50112 268 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C MMS2P53152 137 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C CGR1P53188 120 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C EOS1P53938 366 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C SNA2P56508 79 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C IRC21Q04772 201 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU23Q07987 124 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR268CQ08734 132 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL257WQ08974 193 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YPL261CQ08976 102 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C PAU17Q12370 124 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR010CQ12426 110 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR230W-AQ3E762 66 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YLL006W-AQ3E814 58 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL134C-AQ45U18 67 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C TDA8Q6B2U8 126 aa0.41□□□□□ -2.34
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL28P02406 149 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YPR170W-BP0C5R9 85 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C DDR48P18899 430 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C ARO2P28777 376 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C POP7P38291 140 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RPF1P38805 295 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C DSE2P38844 325 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C MSL1P40567 111 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YFL067WP43537 175 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YFR057WP43625 151 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C LSM8P47093 109 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL37BP51402 88 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM11P81449 96 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C ABF2Q02486 183 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YML079WQ03629 201 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C NAT5Q08689 176 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C CMC4Q3E7A9 73 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL127C-BQ3E828 52 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C SCS22Q6Q595 175 aa0.4□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL36BO14455 100 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL26AP05743 127 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C FUN14P18411 198 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C HYP2P23301 157 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YEL045CP32616 141 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR027CP38220 110 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RSM18P40033 138 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C OST2P46964 130 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RPL26BP53221 127 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YGR164WP53291 111 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C RSM19P53733 91 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YNL184CP53876 108 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C DDR2P89113 61 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C LSM6Q06406 86 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YOR072WQ08486 104 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C ISU2Q12056 156 aa0.39□□□□□ -2.35
tT(AGU)CtT(AGU)C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.2 ms