RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)P

tK(UUU)P, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)P, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-DR1Q03856 440 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-GR2Q12485 440 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YPR014CQ6B0W2 109 aa2.25□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P PCL2P25693 308 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P APS1P35181 156 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.24□□□□□ -2.05not detected
tK(UUU)PtK(UUU)P YJR146WP47174 117 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P NUP42P49686 430 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P HHO1P53551 258 aa2.24□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P POR1P04840 283 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P SEC4P07560 215 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-DR6P0CX70 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-ER1P0CX71 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-LR2P0CX72 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-PLP0CX73 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-JR1P0CX74 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-LR3P0CX75 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-ML2P0CX76 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YEL008WP40001 126 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YER085CP40058 173 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YGL088WP53151 121 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YIL014C-AQ02598 104 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P PPT2Q12036 173 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-GR1Q12085 440 aa2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P AQY1P0CD91 305 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YAL064WP39711 94 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P CYT2Q00873 224 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P ABF2Q02486 183 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YDR042CQ03205 200 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P CMC2Q3E7A4 109 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa2.22□□□□□ -2.05
tK(UUU)PtK(UUU)P YAL065CO13511 128 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P QCR8P08525 94 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P HMRA2P0CY13 119 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P HAP3P13434 144 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P GSP1P32835 219 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P PET8P38921 284 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P NSE4P43124 402 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YFL067WP43537 175 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YFL019CP43576 117 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR295CQ03559 197 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR194CQ05777 254 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR307C-AQ3E825 87 aa2.21□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ECM12O13529 151 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P STF1P01098 86 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P AQY2P0CD90 149 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P OXA1P39952 402 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P TPT1Q12272 230 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.2□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ADH1P00330 348 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ATP15P21306 62 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P TOA2P32774 122 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YKL070WP36087 169 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P SHU1P38751 150 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P COX14P39103 70 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P PEX22P39718 180 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P PEX17P40155 199 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P AIM19P40502 157 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P MMS2P53152 137 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YMR103CQ04436 120 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P CNL1Q06333 122 aa2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR050CQ12155 161 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YBR219CP38317 127 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P CWP2P43497 92 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ARL3Q02804 198 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR112WQ12130 139 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P COA3Q3E7B2 85 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P Q0032Q9ZZX7 96 aa2.18□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YBL039W-BP0C268 59 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YJL197C-AP0C5P0 93 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YER039C-AP0CD97 72 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P CDC43P18898 376 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P PAU16P35994 123 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P MVB12P42939 101 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YML079WQ03629 201 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YML108WQ03759 105 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YPL261CQ08976 102 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P KTI11Q3E840 82 aa2.17□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YLR415CO13578 112 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P SMP1P38128 452 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P YER134CP40081 178 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P CGR1P53188 120 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P ATP16Q12165 160 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P COA6Q3E846 104 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P SCS22Q6Q595 175 aa2.16□□□□□ -2.06
tK(UUU)PtK(UUU)P HYP2P23301 157 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 65 ms