RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W YLR281CQ05863 155 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W RPA12P32529 125 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W SMP1P38128 452 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W YBL071CP38185 102 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W WWM1P43582 211 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W YPS5P53057 165 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa3.73□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.72□□□□□ -1.81not detected
YMR196WYMR196W YER181CP40097 107 aa3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W PEX17P40155 199 aa3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W SDS23P53172 527 aa3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W MSA1Q08471 629 aa3.72□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W RPL32P38061 130 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W TDA4P47153 279 aa3.71□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W GPI19Q04082 140 aa3.71□□□□□ -1.81
YMR196WYMR196W IRC22P40006 225 aa3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YIL102C-AQ2V2P5 75 aa3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W SPG4Q04438 115 aa3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W Q0255P03881 472 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W UBC4P15731 148 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W SVP26P38869 228 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W IRC23Q08416 157 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YIL163CP40448 117 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YLR363W-AQ3E747 85 aa3.7□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W HSP10P38910 106 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YGL034CP53186 121 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W FIT2Q08906 153 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W HTL1Q9URQ5 78 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W AYT1Q12226 474 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YHR213WP0CI67 198 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W PAU16P35994 123 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W IMP2P46972 177 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YML122CQ03207 126 aa3.69□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W NRG2P38082 220 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W PAU5P43575 122 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W KEG1P43614 200 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W DAD1Q12248 94 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YOR376W-AQ3E805 51 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W HSP12P22943 109 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W RRT1P38192 103 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YHR173CP38864 112 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YGL193CP53097 103 aa3.68□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YMR175W-AQ3E766 64 aa3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YCL021W-AQ96VH3 125 aa3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W TOM6P33448 61 aa3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W HUA1P40325 198 aa3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W TOM7P53507 60 aa3.67□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YGL088WP53151 121 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W ATP19P81451 68 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W MIC10Q96VH5 97 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YLR112WQ12130 139 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YAL063C-AQ3E791 96 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YFL041W-AQ3E817 63 aa3.66□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa3.65□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
YMR196WYMR196W YDR042CQ03205 200 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YOR105WQ08504 108 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RRT15Q3E811 62 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YHR139C-AO13536 103 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RPB9P27999 122 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W POP3P53833 195 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YML079WQ03629 201 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W FZF1P32805 299 aa3.64□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W NHP2P32495 156 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YPT10P38146 199 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YMR141CP40211 102 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W POR2P40478 281 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YJL028WP47062 111 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YMR181CQ03231 154 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W SRL1Q08673 210 aa3.63□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RPL15AP05748 204 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W SEC11P15367 167 aa3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YFR035CP43608 114 aa3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W VPS55P47111 140 aa3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W EMC6Q12431 108 aa3.62□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W BET1P22804 142 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YGR025WP53216 100 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YCR041WP37265 110 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W DAD4P69851 72 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W HOR7Q05827 59 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YLR296WQ05898 108 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YPR013CQ12145 317 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YHL042WP38729 150 aa3.61□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
YMR196WYMR196W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms