RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	YDL241W	Q07738	123 aa		3	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YGL010W	P25338	174 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YKL044W	P36092	106 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YBR032W	P38223	100 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	NAT5	Q08689	176 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	EMC6	Q12431	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	FYV5	P25585	152 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YEL067C	P39978	195 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	GPI19	Q04082	140 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	HPA3	P39979	161 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YFR035C	P43608	114 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YJR146W	P47174	117 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	COA6	Q3E846	104 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPS1B	YML063W	COX5B	P00425	151 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	COX8	P04039	78 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	HAP3	P13434	144 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YGL149W	P53116	101 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	BLM10	P43583	2143 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	AGA2	P32781	87 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YHR022C	P38763	256 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	BPH1	P25356	2167 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YPR096C	O13587	100 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	STF2	P16965	84 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	HSP150	P32478	413 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	ECM31	P38122	312 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YHR130C	P38834	111 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	FIT1	Q04433	528 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	FLO9	P39712	1322 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	MIX14	Q04341	121 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	FUN14	P18411	198 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YCL042W	P25572	119 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	FMT1	P32785	401 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	VMA21	P41806	77 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YJL144W	P47009	104 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	CYT2	Q00873	224 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	DAD1	Q12248	94 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	GTT1	P40582	234 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	DCV1	P43595	202 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	GPI11	Q06636	219 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YOL131W	Q08270	108 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	SCP1	Q08873	200 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	FIT2	Q08906	153 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		2.91	□□□□□ -1.94
RPS1B	YML063W	DSE2	P38844	325 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	NCE101	Q02820	53 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	ELP6	Q04868	273 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	MHF1	Q3E835	90 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	UBC4	P15731	148 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	UTR5	P32630	166 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	SPO73	P40031	143 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	IGO1	P53897	168 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	RPB7	P34087	171 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YEL014C	P39999	101 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	HUR1	P45820	110 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	BRP1	P53194	125 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	FIT3	Q08907	204 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YER187W	P40102	141 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YFL051C	P43552	160 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	IPT1	P38954	527 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	HPA2	Q06592	156 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	YDR029W	Q12111	104 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	EMC5	P40540	141 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	OST5	Q92316	86 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
RPS1B	YML063W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	2.84	□□□□□ -1.95	not detected
RPS1B	YML063W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95

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