RNA–Protein interactions for RNA: YKR032W

YKR032W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKR032W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR032W	YKR032W	YGR025W	P53216	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	YLR194C	Q05777	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	YOL085C	Q99345	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	YPT53	P36019	220 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	YNL092W	P53934	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	AIM34	Q03673	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YKR032W	YKR032W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
YKR032W	YKR032W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YER135C	P40082	130 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	PEX17	P40155	199 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	CAX4	P53223	239 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	SCW10	Q04951	389 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	IRA1	P18963	3092 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	TRP1	P00912	224 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	ATP15	P21306	62 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YCH1	P42937	148 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YJR146W	P47174	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YLR042C	Q07990	161 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YPR013C	Q12145	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	ATX1	P38636	73 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	VHS2	P40463	436 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YFR057W	P43625	151 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YNR077C	P53758	84 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	MRPS8	Q03799	155 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YMR244W	Q04018	355 aa		5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	CDC43	P18898	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	MIG3	P39943	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YEL067C	P39978	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YER085C	P40058	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	HPA2	Q06592	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	MSA1	Q08471	629 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	CYC7	P00045	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	SIM1	P40472	476 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	ALG13	P53178	202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	RPB9	P27999	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YBR209W	P38311	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
YKR032W	YKR032W	PMP3	P87284	55 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	BPH1	P25356	2167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YKR032W	YKR032W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	QCR8	P08525	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	SHU1	P38751	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	OST2	P46964	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	UGX2	P32772	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RRT13	P40042	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YIL059C	P40520	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	PPT2	Q12036	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YCR041W	P37265	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YAR029W	P39549	74 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YHR130C	P38834	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YEL008W	P40001	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YGL088W	P53151	121 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	INO4	P13902	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	COX10	P21592	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	MID2	P36027	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	NRG2	P38082	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	MPC2	P38857	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	MRPS12	P53732	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	YNL190W	P53872	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	ABF2	Q02486	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR032W	YKR032W	UBC5	P15732	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YCR085W	P25650	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YFR035C	P43608	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YPS5	P53057	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	EOS1	P53938	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YKR032W	YKR032W	YIA6	P40556	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	FIP1	P45976	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YDL186W	P48568	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	YBR144C	P34215	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR032W	YKR032W	DSE2	P38844	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26 ms