RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C YHR139C-AO13536 103 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YBR121C-AP0C5L4 52 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C MRPL39P36533 70 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C MBB1P39534 108 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
SOP4YJL192C YER121WP40076 114 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C HUA1P40325 198 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C ECO1P43605 281 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YFR057WP43625 151 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C CAX4P53223 239 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C TIM10P87108 93 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C IRC23Q08416 157 aa2.96□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C HMRA2P0CY13 119 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C LDB16P25587 256 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C SMP1P38128 452 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YER084WP40057 128 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YIA6P40556 373 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C VPS55P47111 140 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C SBH1P52870 82 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YGR039WP53225 103 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C AIM34Q03673 198 aa2.95□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C INO2P26798 304 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C MSA2P36157 363 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C AIM19P40502 157 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C CWP2P43497 92 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YFL051CP43552 160 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C MRPS12P53732 153 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C AIM11P87275 137 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.94□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YKR045CP36138 183 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C RRT1P38192 103 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C SVP26P38869 228 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C COF1Q03048 143 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YLR412C-AQ3E742 68 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C KTI11Q3E840 82 aa2.93□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YBR144CP34215 104 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C MTC6P38849 526 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C KRE9P39005 276 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YER085CP40058 173 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C PEX17P40155 199 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YDR029WQ12111 104 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YMR175W-AQ3E766 64 aa2.92□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C HFA1P32874 2273 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C BPH1P25356 2167 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C DSE2P38844 325 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C CTR2P38865 189 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C DCV1P43595 202 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C PIR5P46999 287 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C KNH1P50112 268 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C SIP18P50263 79 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C ALG13P53178 202 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YGR164WP53291 111 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YMR181CQ03231 154 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C DAP1Q12091 152 aa2.91□□□□□ -1.94
SOP4YJL192C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C SIM1P40472 476 aa2.9□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YJR146WP47174 117 aa2.9□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C TRP1P00912 224 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C QCR8P08525 94 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YKL097CP34245 136 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YSY6P38374 65 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C MPC2P38857 129 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YDR114CQ04597 100 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C GAT3Q07928 141 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YDL009CQ12210 107 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C PRM7Q12459 698 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YMR105W-AQ8TGS8 64 aa2.89□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C CSF1Q12150 2958 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPS23BP0CX30 145 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C ATP15P21306 62 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YCR050CP25630 102 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C IES6P32617 166 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C GAT4P40569 121 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YGR219WP53307 113 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YOL160WQ08321 113 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C PPT2Q12036 173 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YOR029WQ12243 111 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C EMC6Q12431 108 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YDR246W-AQ3E763 66 aa2.88□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RRT13P40042 185 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C POR2P40478 281 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C HUR1P45820 110 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C RGM1Q00453 211 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C YDR209CQ03480 137 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C PBA1Q05778 276 aa2.87□□□□□ -1.95
SOP4YJL192C TAO3P40468 2376 aa2.86□□□□□ -1.95
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