RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YER085CP40058 173 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YNL194CP40169 301 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YFR035CP43608 114 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W CYT2Q00873 224 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W COX12Q01519 83 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W MRPS8Q03799 155 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W GPI19Q04082 140 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YLR342W-AQ3E810 57 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YIL134C-AQ45U18 67 aa2.26□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YCR023CP25351 611 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W UTR5P32630 166 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W TEM1P38987 245 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YNL217WP40152 326 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W ATP19P81451 68 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YLR042CQ07990 161 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W NUM1Q00402 2748 aa2.25□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PAU19P0CE85 124 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PAU21P0CE86 164 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PAU22P0CE87 164 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W HMRA1P0CY11 126 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W HMRA2P0CY13 119 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PAU3P25610 124 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W SRP21P32342 167 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W OST3P48439 350 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W ERV14P53173 138 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PMP3P87284 55 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W SGF11Q03067 99 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W DGA1Q08650 418 aa2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
THP2YHR167W TIR1P10863 254 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YKL070WP36087 169 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YKR032WP36127 104 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YER076CP40049 302 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W DCV1P43595 202 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YLR118CQ12354 227 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YBR200W-AQ3E755 54 aa2.23□□□□□ -2.05
THP2YHR167W URA2P07259 2214 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W VAR1P02381 398 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W FUN14P18411 198 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W GSP1P32835 219 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W GSP2P32836 220 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W APS1P35181 156 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YDR366CP87287 132 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W AIM34Q03673 198 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W CCW12Q12127 133 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W HTL1Q9URQ5 78 aa2.22□□□□□ -2.05
THP2YHR167W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YIL014C-AQ02598 104 aa2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YPL261CQ08976 102 aa2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.21□□□□□ -2.06
THP2YHR167W TRA1P38811 3744 aa2.2□□□□□ -2.06
THP2YHR167W ATP15P21306 62 aa2.2□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YJL028WP47062 111 aa2.2□□□□□ -2.06
THP2YHR167W CWC27Q02770 301 aa2.2□□□□□ -2.06
THP2YHR167W RRT15Q3E811 62 aa2.2□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
THP2YHR167W RPF1P38805 295 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
THP2YHR167W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.19□□□□□ -2.06not detected
THP2YHR167W YMR103CQ04436 120 aa2.19□□□□□ -2.06
THP2YHR167W NAT5Q08689 176 aa2.19□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YAR023CD6VPM8 179 aa2.18□□□□□ -2.06
THP2YHR167W RPL28P02406 149 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
THP2YHR167W POP7P38291 140 aa2.18□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YAL064WP39711 94 aa2.18□□□□□ -2.06
THP2YHR167W COA6Q3E846 104 aa2.18□□□□□ -2.06
THP2YHR167W PFY1P07274 126 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W ANB1P19211 157 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W SPI1P40092 148 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YPL073CP40323 161 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W GLC8P41818 229 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W BRP1P53194 125 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W SNA2P56508 79 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W SAE3P89114 91 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W RGM1Q00453 211 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W FYV7Q12247 151 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YGR240C-AQ3E786 66 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W CMC2Q3E7A4 109 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W ISD11Q6Q560 94 aa2.17□□□□□ -2.06
THP2YHR167W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
THP2YHR167W MRPL44P19956 98 aa2.16□□□□□ -2.06
THP2YHR167W PAU16P35994 123 aa2.16□□□□□ -2.06
THP2YHR167W YEL008WP40001 126 aa2.16□□□□□ -2.06
THP2YHR167W SPC1P46965 94 aa2.16□□□□□ -2.06
THP2YHR167W LSM8P47093 109 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 104.8 ms