RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250237.9

QTRT1-201, Transcript of queuine tRNA-ribosyltransferase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene QTRT1, Length 1,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QTRT1-201ENST00000250237 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
QTRT1-201ENST00000250237 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.53■■□□□ 1.04
QTRT1-201ENST00000250237 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.53■■□□□ 1.04
QTRT1-201ENST00000250237 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.53■■□□□ 1.04
QTRT1-201ENST00000250237 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.53■■□□□ 1.04
QTRT1-201ENST00000250237 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PSMA7O14818 248 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PFKLP17858 780 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 GTF2H1P32780 548 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 IFNAR2P48551 515 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 MXI1P50539 228 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FAM35AQ86V20 835 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 UNC93AQ86WB7 457 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CLDN23Q96B33 292 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.52■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ARNTLO00327 626 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TADA3O75528 432 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 SP9P0CG40 484 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 HDCP19113 662 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CTHP32929 405 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PRCPP42785 496 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 LRRC63Q05C16 580 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 MTF1Q14872 753 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PDGFRLQ15198 375 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NUP93Q8N1F7 819 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 GKN1Q9NS71 199 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CCL26Q9Y258 94 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.51■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CLDN5O00501 218 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 SOX9P48436 509 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NDST1P52848 882 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 RUNX3Q13761 415 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 WDR44Q5JSH3 913 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ACOT1Q86TX2 421 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CPA6Q8N4T0 437 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TTC39CQ8N584 583 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FBXO32Q969P5 355 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CHRDQ9H2X0 955 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 KRT82Q9NSB4 513 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.5■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PRR23AA6NEV1 266 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 AP1G2O75843 785 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 YWHAQP27348 245 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ASPAP45381 313 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CCR3P51677 355 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NR1H3Q13133 447 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ATP2A3Q93084 1043 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 HINFPQ9BQA5 517 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 EBF3Q9H4W6 596 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NME7Q9Y5B8 376 aa21.49■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 C2orf78A6NCI8 922 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 CD58P19256 250 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TNK2Q07912 1038 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PPP3CAQ08209 521 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 PON2Q15165 354 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NACA2Q9H009 215 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 R4GN57 208 aa21.48■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 LMNAP02545 664 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 FAM200BP0CF97 657 aa21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 NRLP54845 237 aa21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 USP46P62068 366 aa21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 TAF10Q12962 218 aa21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 USP4Q13107 963 aa21.47■■□□□ 1.03
QTRT1-201ENST00000250237 MTAPQ13126 283 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms