RNA–Protein interactions for RNA: YOR099W

KTR1, Transcript of Alpha-1,2-mannosyltransferase, yeast

Gene KTR1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR1	YOR099W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YCR007C	P25354	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YKR032W	P36127	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	PET8	P38921	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	GLC8	P41818	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YGL230C	P53074	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	MSC3	Q05812	728 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	RRG8	Q06109	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	TRA1	P38811	3744 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	SEC11	P15367	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YCR041W	P37265	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YHR022C	P38763	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	CAX4	P53223	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	PRM3	Q08931	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	PRM7	Q12459	698 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KTR1	YOR099W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YCR023C	P25351	611 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	AGA1	P32323	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MHR1	Q06630	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	PAU23	Q07987	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	CCW12	Q12127	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	PAU17	Q12370	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MIG1	P27705	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	APS1	P35181	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	KEG1	P43614	200 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	ATP23	P53722	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	TVP18	Q04767	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	SAL1	D6W196	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	HAP3	P13434	144 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YER076C	P40049	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YER135C	P40082	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MGR2	Q02889	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	BPH1	P25356	2167 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	PFY1	P07274	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	UTR5	P32630	166 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	ELF1	P36053	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	SIM1	P40472	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	VPS71	Q03433	280 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	BET5	Q03630	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	CCW14	O13547	238 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	VAR1	P02381	398 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	PCL2	P25693	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	FIP1	P45976	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	TOR1	P35169	2470 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MEC1	P38111	2368 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YCL042W	P25572	119 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	UIP3	P39547	235 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	MIG3	P39943	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	TOS6	P48560	102 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	CWC27	Q02770	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KTR1	YOR099W	Q0255	P03881	472 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YKL044W	P36092	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	GLO1	P50107	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YDR366C	P87287	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YDL186W	P48568	277 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	MIC26	P50087	233 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	ALG13	P53178	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	DGA1	Q08650	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	DCV1	P43595	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YKL070W	P36087	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YML079W	Q03629	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	AIM34	Q03673	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR1	YOR099W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.9 ms