RNA–Protein interactions for RNA: YNR048W

YNR048W, Transcript of Potential noncatalytic subunit for phospholipid translocase Dnf3p, yeast

Gene YNR048W, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR048W	YNR048W	YGL010W	P25338	174 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	APS2	Q00381	147 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	DCN1	Q12395	269 aa		4.27	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	COX2	P00410	251 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAU5	P43575	122 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	FIP1	P45976	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	ATP19	P81451	68 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	ECM19	Q06011	112 aa		4.26	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	HTB2	P02294	131 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAU3	P25610	124 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YNL194C	P40169	301 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YMR141C	P40211	102 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YAR1	P46683	200 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YGR025W	P53216	100 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	UBC7	Q02159	165 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.25	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	CUP2	P15315	225 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	COX10	P21592	462 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	QRI5	P32344	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	FZF1	P32805	299 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	PAM17	P36147	197 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	MSA1	Q08471	629 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.24	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	TIR1	P10863	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	SNF11	P38956	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	CAX4	P53223	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	DAD4	P69851	72 aa		4.23	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	AME1	P38313	324 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	YFR045W	P43617	309 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	ARL3	Q02804	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	GIM5	Q04493	163 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	ATG39	Q06159	398 aa		4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
YNR048W	YNR048W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SUR2	P38992	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	IRC22	P40006	225 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	RPA43	P46669	326 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	PRM3	Q08931	133 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	DAD1	Q12248	94 aa		4.21	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	MRPL28	P36527	147 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	CYT2	Q00873	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	DXO1	Q06349	442 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	PRM7	Q12459	698 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.2	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	PRY2	P36110	329 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	RPB11	P38902	120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YIP3	P53633	176 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.19	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	CPT1	P17898	393 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SSS1	P35179	80 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SPI1	P40092	148 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	AGE2	P40529	298 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YHR022C	P38763	256 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	TDA4	P47153	279 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	SEN15	Q04675	128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	CSM4	Q08955	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	UTR5	P32630	166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	PAU7	P39545	55 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YER135C	P40082	130 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	YGR017W	P53210	297 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YNR048W	YNR048W	MIC26	P50087	233 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	UPS3	Q04006	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	GTO3	Q04806	366 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	CCW12	Q12127	133 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	TIM22	Q12328	207 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	YKL102C	P34249	101 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	OST3	P48439	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	YER134C	P40081	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	YFR035C	P43608	114 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	ALG13	P53178	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YNR048W	YNR048W	GPI19	Q04082	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.6 ms