RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W UGX2P32772 223 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W SEN15Q04675 128 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YIR021W-AQ3E739 70 aa2.18□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W LTE1P07866 1435 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YHR213WP0CI67 198 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W HAP3P13434 144 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YAR064WP39563 99 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W LST8P41318 303 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-FP0CX63 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-CP25384 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-DR2Q03494 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY1B-DR1Q03855 1755 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-OR1Q12113 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-DR1Q12472 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-OR2Q12501 1770 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YOR093CQ12275 1648 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W HAP1P0CE41 1502 aa2.17□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W ERV14P53173 138 aa2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YMR007WQ03675 126 aa2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W AIM36Q03798 255 aa2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YMR122CQ03879 124 aa2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W YOR376W-AQ3E805 51 aa2.16□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W TY2B-BQ12491 1770 aa2.15□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W CDC25P04821 1589 aa2.15□□□□□ -2.06
YKR047WYKR047W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W SEC59P20048 519 aa2.15□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W BUD3P25558 1636 aa2.15□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W PDR11P40550 1411 aa2.15□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W SNF2P22082 1703 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W RTC6O14464 93 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W RPB11P38902 120 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YLR296WQ05898 108 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W DOP1Q03921 1698 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W NTE1Q04958 1679 aa2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YKL044WP36092 106 aa2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W HUA1P40325 198 aa2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W CCW12Q12127 133 aa2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W GTT2Q12390 233 aa2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W GSC2P40989 1895 aa2.13□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W KRE5P22023 1365 aa2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W IML1P47170 1584 aa2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YSP2Q06681 1438 aa2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W UTP11P34247 250 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W LDB18Q07887 179 aa2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W PRM3Q08931 133 aa2.12□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-HO13535 1793 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-JR1P47098 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-ER1Q03612 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-GR2Q12269 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-OLQ12273 1755 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W PFY1P07274 126 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W IRC21Q04772 201 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W KTI11Q3E840 82 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W SPO14P36126 1683 aa2.11□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W LYS2P07702 1392 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W VMR1P38735 1592 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W NUP192P47054 1683 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YOR304C-AO14468 76 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W AIM18P38884 321 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YIL102CP40488 101 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W GPI19Q04082 140 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-BRQ12193 1756 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-GR3Q12316 1755 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-ORQ92393 1755 aa2.1□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-ER2Q03619 1755 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-MR1Q04214 1755 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-NL1Q12112 1755 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-GR1Q12141 1755 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W TY1B-BLQ12490 1755 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YCR001WP25347 104 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W SNF11P38956 169 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YFR035CP43608 114 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W ARL3Q02804 198 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W COA4Q05809 96 aa2.09□□□□□ -2.07
YKR047WYKR047W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.1 ms