RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W TVP18Q04767 167 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W ATP20Q12233 115 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W RAS2P01120 322 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YHR032W-AP0C5N6 59 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W KRE9P39005 276 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W NSE4P43124 402 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YNR064CP53750 290 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W ATP19P81451 68 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W ANT1Q06497 328 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data3.01□□□□□ -1.93not detected
PIR3YKL163W ATO3Q12359 275 aa3.01□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W DDR48P18899 430 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W RRT1P38192 103 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YBR090CP38253 122 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W TRS20P38334 175 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YHR180WP38868 163 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W SMX2P40204 77 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YPI1P43587 155 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YNR062CP53748 327 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W PIN3Q06449 215 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YLR042CQ07990 161 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MHF1Q3E835 90 aa3□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W PRE1P22141 198 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MRS4P23500 304 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YEA6P39953 335 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W SIP18P50263 79 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W SAY1P53324 424 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W SED1Q01589 338 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W RCE1Q03530 315 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W UPS1Q05776 175 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YPR063CQ12160 140 aa2.99□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W BPH1P25356 2167 aa2.98□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W PAM17P36147 197 aa2.98□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W GAT4P40569 121 aa2.98□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W UIP4Q08926 304 aa2.98□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W URA2P07259 2214 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MID2P36027 376 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YER084WP40057 128 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YNL217WP40152 326 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MPM1P40364 252 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W HAL1Q01766 294 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W RIM9Q04734 239 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W IRC19Q07843 230 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W CSI2Q08054 341 aa2.97□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YCR050CP25630 102 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W FZF1P32805 299 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YIR035CP40579 254 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W DOC1P53068 250 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W THG1P53215 237 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YGR164WP53291 111 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W MPC3P53311 146 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOL131WQ08270 108 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOR268CQ08734 132 aa2.96□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W RPS23BP0CX30 145 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W CLB6P32943 380 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W TMA19P35691 167 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W FLX1P40464 311 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W IRC23Q08416 157 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W FIT3Q08907 204 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W SCS22Q6Q595 175 aa2.95□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W UBC5P15732 148 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W SCM4P32564 187 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W SDH4P37298 181 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W PAM16P42949 149 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W SMD3P43321 101 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W DIE2P50076 525 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W DAD3P69850 94 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOR015WQ12169 119 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOR343CQ12484 108 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOR381W-AQ3E804 55 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W ATG40Q99325 256 aa2.94□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W GTT1P40582 234 aa2.93□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W UPS3Q04006 179 aa2.93□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.93□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YOL162WP0CF19 215 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W PEX4P29340 183 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YEL045CP32616 141 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W MRPS9P38120 278 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YBR209WP38311 105 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YAR029WP39549 74 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YML079WQ03629 201 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YDR114CQ04597 100 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W KEI1Q06346 221 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YGR035W-AQ45U48 73 aa2.92□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W TIM12P32830 109 aa2.91□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W TIR3P40552 269 aa2.91□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W YHP1Q04116 353 aa2.91□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PIR3YKL163W HAP3P13434 144 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YBR032WP38223 100 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YAL064WP39711 94 aa2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W SNU13P39990 126 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PIR3YKL163W YNR077CP53758 84 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.5 ms