RNA–Protein interactions for RNA: YHR146W

CRP1, Transcript of Protein that binds to cruciform DNA structures, yeast

Gene CRP1, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRP1	YHR146W	YDL009C	Q12210	107 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YPT53	P36019	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	GPI19	Q04082	140 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YPL257W	Q08974	193 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YHL044W	P38727	235 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YIP1	P53039	248 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	MST27	P53176	234 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	JID1	Q12350	301 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	POP7	P38291	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	ECM14	P38836	430 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YER121W	P40076	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YMR103C	Q04436	120 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	IRC23	Q08416	157 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	DGA1	Q08650	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YHR140W	P38842	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	CIN5	P40917	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	SUR7	P54003	302 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	MGR2	Q02889	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YML122C	Q03207	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	YLR296W	Q05898	108 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	GEP3	Q08622	556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	SPO24	Q3E752	67 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	SLO1	Q3E784	85 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CRP1	YHR146W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	IES6	P32617	166 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	GPI18	P38211	433 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	MST28	P39552	234 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YER076C	P40049	302 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YPL073C	P40323	161 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YLR112W	Q12130	139 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	FCY1	Q12178	158 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	TIM22	Q12328	207 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	UBC7	Q02159	165 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	ELC1	Q03071	99 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	SNA4	Q07549	140 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.01	□□□□□ -1.61	not detected
CRP1	YHR146W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	IRA2	P19158	3079 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	PFY1	P07274	126 aa		5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	SNF11	P38956	169 aa		5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	ATP23	P53722	227 aa		5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	SCW10	Q04951	389 aa		5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YDL186W	P48568	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YOL160W	Q08321	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YKR041W	P36134	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	DIA1	P54005	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	SPI1	P40092	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	TOS6	P48560	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CRP1	YHR146W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YEL067C	P39978	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YER181C	P40097	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	POR2	P40478	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	LCB3	P47013	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	MSA1	Q08471	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	PHO85	P17157	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	AGA1	P32323	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YGL260W	P53056	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YNR077C	P53758	84 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YCR041W	P37265	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	OXA1	P39952	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YGR025W	P53216	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YGR219W	P53307	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YER085C	P40058	173 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YFR057W	P43625	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	PRM3	Q08931	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	BPH1	P25356	2167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	HOT13	P36078	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	SBH2	P52871	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	IRA1	P18963	3092 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRP1	YHR146W	VAR1	P02381	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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