RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.44	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RRT13	P40042	185 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YCH1	P42937	148 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	AIM34	Q03673	198 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	DXO1	Q06349	442 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	VAM10	Q08474	114 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		6.42	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	ELF1	P36053	145 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	SGF11	Q03067	99 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	6.41	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	SDH8	P38345	138 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	YPS5	P53057	165 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	CYT2	Q00873	224 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SPS100	YHR139C	MRPL33	P20084	86 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	MRPL28	P36527	147 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YGR149W	P48236	432 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	ARL3	Q02804	198 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	TVP18	Q04767	167 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YLR042C	Q07990	161 aa		6.39	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YKR032W	P36127	104 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	HAL1	Q01766	294 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YCR023C	P25351	611 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YNL217W	P40152	326 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	PET8	P38921	284 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	KRE9	P39005	276 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	ATP16	Q12165	160 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	TEM1	P38987	245 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	DGA1	Q08650	418 aa		6.34	□□□□□ -1.39
SPS100	YHR139C	SAL1	D6W196	494 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YPT53	P36019	220 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	DCV1	P43595	202 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YGL118C	P53132	145 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	ATP23	P53722	227 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		6.31	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	PFY1	P07274	126 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YER076C	P40049	302 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YER134C	P40081	178 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	PMP3	P87284	55 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	MED7	Q08278	222 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	CRC1	Q12289	327 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	SSS1	P35179	80 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	GLO1	P50107	326 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	MGR2	Q02889	113 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SPS100	YHR139C	UBC5	P15732	148 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	AQY1	P0CD91	305 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	RPR2	P40571	144 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	PCL2	P25693	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	OST3	P48439	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	TOS6	P48560	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	ERV14	P53173	138 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	MRP49	P32388	137 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YBR209W	P38311	105 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	SPC1	P46965	94 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	SEN15	Q04675	128 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	DPP1	Q05521	289 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	6.22	□□□□□ -1.41	not detected
SPS100	YHR139C	YIL059C	P40520	121 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YJL028W	P47062	111 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YJR146W	P47174	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YDR042C	Q03205	200 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SPS100	YHR139C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	YGL088W	P53151	121 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SPS100	YHR139C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42

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