RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STF2	YGR008C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	AVO2	Q04749	426 aa		0.11	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	SHH4	Q06236	168 aa		0.11	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	PEX27	Q08580	376 aa		0.11	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		0.11	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	ERV15	P38312	142 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	AME1	P38313	324 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	FMC1	P40491	155 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	YML018C	Q03730	393 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	SCP1	Q08873	200 aa		0.1	□□□□□ -2.39
STF2	YGR008C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	HMX1	P32339	317 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	OXA1	P39952	402 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	POG1	P40473	351 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SHH3	Q04487	196 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	GTO3	Q04806	366 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.09	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	QCR2	P07257	368 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	MRP17	P28778	131 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	TOA2	P32774	122 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YHR122W	P38829	231 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SWM2	P40342	146 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	DOC1	P53068	250 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YNL190W	P53872	204 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SYM1	Q06563	197 aa		0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	GCN3	P14741	305 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	PAU16	P35994	123 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YKL162C	P36052	402 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.07	□□□□□ -2.4	not detected
STF2	YGR008C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YKR041W	P36134	250 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	POP8	P38208	133 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YMR141C	P40211	102 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	MVB12	P42939	101 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	PET20	Q99373	253 aa		0.07	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	FUN14	P18411	198 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SHU1	P38751	150 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YER085C	P40058	173 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YGR026W	P53217	278 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	PDR17	P53844	350 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	MRPS16	Q02608	121 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	ACL4	Q03771	387 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YPL257W	Q08974	193 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		0.06	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YLR255C	O13574	117 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	TRP1	P00912	224 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	HIS3	P06633	220 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YIA6	P40556	373 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	ABF2	Q02486	183 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YMR295C	Q03559	197 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	DAD1	Q12248	94 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SCS22	Q6Q595	175 aa		0.05	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	APS1	P35181	156 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	AIM29	P36154	155 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YBR209W	P38311	105 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YEL008W	P40001	126 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YGR269W	P40326	108 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YGL088W	P53151	121 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YNL184C	P53876	108 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	DAD4	P69851	72 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	MGR3	Q04472	501 aa		0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.04	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	UIP3	P39547	235 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YEA4	P40004	342 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	AIM25	P47140	327 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	BSC4	P53841	131 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	GIM3	P53900	129 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	TVP18	Q04767	167 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.03	□□□□□ -2.4
STF2	YGR008C	NVJ1	P38881	321 aa		0.02	□□□□□ -2.41
STF2	YGR008C	COX14	P39103	70 aa		0.02	□□□□□ -2.41
STF2	YGR008C	HIT1	P46973	164 aa		0.02	□□□□□ -2.41
STF2	YGR008C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
STF2	YGR008C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41
STF2	YGR008C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	0.02	□□□□□ -2.41

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