RNA–Protein interactions for RNA: YLR466W

YRF1-4, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeast

Gene YRF1-4, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YRF1-4	YLR466W	MIX23	P38162	196 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SRP14	P38985	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MBB1	P39534	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	POR2	P40478	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	AIM24	P47127	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	COX18	P53239	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	CAB4	P53332	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YNL234W	P53857	426 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPS1	P32329	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	CCW14	O13547	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	ZRT1	P32804	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPI1	P43587	155 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPT53	P36019	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	TOS8	P53147	276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YBR090C	P38253	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	UPS3	Q04006	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	MDM10	P18409	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SNF11	P38956	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	TIM18	Q08749	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YRF1-4	YLR466W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	NCE103	P53615	221 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	SPG4	Q04438	115 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	ATG39	Q06159	398 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	GEP3	Q08622	556 aa		4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YKR045C	P36138	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	DUG3	P53871	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	IZH1	Q03419	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	IRC23	Q08416	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	CMC1	P36064	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	CYC3	P06182	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	ATP5	P09457	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	OXA1	P39952	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	MST27	P53176	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	PRM3	Q08931	133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YER134C	P40081	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	SCM4	P32564	187 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	ERS1	P17261	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	PRY2	P36110	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	HOR7	Q05827	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	FZF1	P32805	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	PAU16	P35994	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	MHR1	Q06630	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
YRF1-4	YLR466W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	TEM1	P38987	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	VPS55	P47111	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	INO4	P13902	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YMR141C	P40211	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	ABF2	Q02486	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	TIM22	Q12328	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YHR140W	P38842	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	KEG1	P43614	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	IMP2	P46972	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	TMA10	Q06177	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	IZH3	Q07959	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	MET32	Q12041	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	CPT1	P17898	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YRF1-4	YLR466W	YML079W	Q03629	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63.1 ms