RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W MCH1Q07376 486 aa3.11□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.11□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W ODC2Q99297 307 aa3.11□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YAR023CD6VPM8 179 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W CCW14O13547 238 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W RAD6P06104 172 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W TOM40P23644 387 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W HSP150P32478 413 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W ETR1P38071 380 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W UMP1P38293 148 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YHL037CP38733 133 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YER188WP40103 239 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W SFT1P43682 97 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YGR026WP53217 278 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W SCW10Q04951 389 aa3.1□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W COX10P21592 462 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W HYM1P32464 399 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W LHP1P33399 275 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YHR140WP38842 239 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data3.09□□□□□ -1.91not detected
PIR3YKL163W NSA2P40078 261 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W SBH1P52870 82 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YDR274CP87283 123 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YKR005CQ02203 525 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W GRX5Q02784 150 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W SML1Q04964 104 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W NAT3Q06504 195 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W RAF1Q06891 181 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W YKL068W-AQ3E826 78 aa3.09□□□□□ -1.91
PIR3YKL163W HSP12P22943 109 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W AHT1P29589 182 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SPT14P32363 452 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W PEP8P40335 379 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YFL051CP43552 160 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W BUD25P85052 153 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YMR295CQ03559 197 aa3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SPS2P08459 502 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W ANB1P19211 157 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SWD3P38123 315 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W NCE101Q02820 53 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W EST3Q03096 181 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W RRT7Q07829 113 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SAS5Q99314 248 aa3.07□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W MDH2P22133 377 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YOR062CP36025 268 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YER135CP40082 130 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SPG1P50088 95 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W MRPS16Q02608 121 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SHH3Q04487 196 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W GAL83Q04739 417 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SYM1Q06563 197 aa3.06□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SEC59P20048 519 aa3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data3.05□□□□□ -1.92not detected
PIR3YKL163W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W GEP7P53171 287 aa3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YOL085CQ99345 113 aa3.05□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W POR1P04840 283 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W RPB11P38902 120 aa3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SPC25P40014 221 aa3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W ELC1Q03071 99 aa3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W RNH202Q05635 350 aa3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W BLM10P43583 2143 aa3.04□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YPR096CO13587 100 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W MSW1P04803 379 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YKR032WP36127 104 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W SRL3P36167 246 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W CTR2P38865 189 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W PHS1P40857 217 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YFR045WP43617 309 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W GON7P46984 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W IGO1P53897 168 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W YDR102CQ03864 110 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W FYV12Q08559 129 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W HUT1Q12520 339 aa3.03□□□□□ -1.92
PIR3YKL163W DYN1P36022 4092 aa3.03□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W VAR1P02381 398 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W ADK1P07170 222 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YER039C-AP0CD97 72 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W SFT2P38166 215 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YIR020CP40575 100 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W YGL230CP53074 147 aa3.02□□□□□ -1.93
PIR3YKL163W LIP1Q03579 150 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 247.4 ms