RNA–Protein interactions for RNA: YGR041W

BUD9, Transcript of Protein involved in bud-site selection, yeast

Gene BUD9, Length 1,644 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD9	YGR041W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	SNC2	P33328	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YER188W	P40103	239 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	HRT1	Q08273	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	SCP1	Q08873	200 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	YIR035C	P40579	254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	ARL3	Q02804	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	NAT3	Q06504	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BUD9	YGR041W	CLB6	P32943	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	DAN1	P47178	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	NCE101	Q02820	53 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	RRT7	Q07829	113 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	TIR1	P10863	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	MRP49	P32388	137 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YBL010C	P32788	280 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	SDH4	P37298	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	SPC25	P40014	221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
BUD9	YGR041W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	FIT1	Q04433	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	FAB1	P34756	2278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YER181C	P40097	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	VMA21	P41806	77 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	ECO1	P43605	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YFR045W	P43617	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YGR219W	P53307	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	VPS71	Q03433	280 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	COX19	Q3E731	98 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	UMP1	P38293	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YDR274C	P87283	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	GON7	P46984	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	FCY1	Q12178	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	SRP21	P32342	167 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	AGA2	P32781	87 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YEA6	P39953	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	GPI2	P46961	280 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	TMA23	Q03525	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	RAD28	Q12021	506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	PHO85	P17157	305 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YBR013C	P38215	129 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	PAU15	P40585	124 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YGL193C	P53097	103 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	APS2	Q00381	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	RUB1	Q03919	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	SEC59	P20048	519 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YHR180W	P38868	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	ERV14	P53173	138 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BUD9	YGR041W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	UGX2	P32772	223 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	SSS1	P35179	80 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	CTR2	P38865	189 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	RPS27B	P38711	82 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	VPS28	Q02767	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	SCM4	P32564	187 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YBR220C	P38318	560 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YBR292C	P38357	123 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	FLX1	P40464	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	PHS1	P40857	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	IRC19	Q07843	230 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	MSW1	P04803	379 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	MRS4	P23500	304 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	TRS20	P38334	175 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	AVO2	Q04749	426 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YCR101C	P25607	182 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	YKR032W	P36127	104 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BUD9	YGR041W	MRPS9	P38120	278 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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