RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W GAT3Q07928 141 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MSA1Q08471 629 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YPR064WQ12492 139 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YLR146W-AQ2V2P1 62 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YAL063C-AQ3E791 96 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W ODC2Q99297 307 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W UBR2Q07963 1872 aa2.82□□□□□ -1.96
VFA1YER128W ECM15P35195 104 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SMP1P38128 452 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SHE1P38200 338 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YHL042WP38729 150 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YER181CP40097 107 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W POP3P53833 195 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YMR252CQ04814 134 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W IES4Q08561 116 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W TIM18Q08749 192 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YOR015WQ12169 119 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YKL023C-AQ2V2P3 75 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YBR255C-AQ3E776 120 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W HKR1P41809 1802 aa2.81□□□□□ -1.96
VFA1YER128W UBC4P15731 148 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W ARF2P19146 181 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W BET1P22804 142 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MRS4P23500 304 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RFA2P26754 273 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W CSE2P33308 149 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YBR144CP34215 104 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W APS1P35181 156 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W GPX1P36014 167 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PEX17P40155 199 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W GAT4P40569 121 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YNR064CP53750 290 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YNL234WP53857 426 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W COX12Q01519 83 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RRT7Q07829 113 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W EMC6Q12431 108 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YMR030W-AQ3E760 96 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W TSC3Q3E790 80 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SCS22Q6Q595 175 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YER175W-AQ8TGU4 54 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YCL021W-AQ96VH3 125 aa2.8□□□□□ -1.96
VFA1YER128W AHT1P29589 182 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data2.79□□□□□ -1.96not detected
VFA1YER128W SNF11P38956 169 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W TOS8P53147 276 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W MST27P53176 234 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YOR292CQ08743 309 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YOR385WQ08909 290 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RNH203Q12338 110 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W CSR2Q12734 1121 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RPS22BQ3E7Y3 130 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W HTL1Q9URQ5 78 aa2.79□□□□□ -1.96
VFA1YER128W HEM2P05373 342 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU1P0CE88 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU14P0CE89 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU6P0CE90 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU18P0CE91 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU8P0CE92 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU11P0CE93 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W CSH1P38287 376 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W OM14P38325 134 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU13P38725 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W RRT13P40042 185 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU4P53427 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YNL046WP53956 172 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PET191Q02772 108 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU10Q03050 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YDL057WQ07379 328 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU20Q08322 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YOR105WQ08504 108 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YDL009CQ12210 107 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YPL247CQ12523 523 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W PAU9Q3E770 120 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W LAA1P39526 2014 aa2.78□□□□□ -1.96
VFA1YER128W YCR006CP25350 157 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PAU24P38155 120 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YGL034CP53186 121 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W TPC1P53257 314 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SLG1P54867 378 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W HAL1Q01766 294 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YDR042CQ03205 200 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W FSH2Q05015 223 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W STP3Q05937 343 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YMR175W-AQ3E766 64 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MIC10Q96VH5 97 aa2.77□□□□□ -1.97
VFA1YER128W Q0255P03881 472 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W ARF1P11076 181 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SWD3P38123 315 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70 ms