RNA–Protein interactions for RNA: RUF23

RUF23, Transcript of RNA of Unknown Function, yeast

Gene RUF23, Length 254 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RUF23	RUF23	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	SRP14	P38985	146 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	GLE2	P40066	365 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YFR045W	P43617	309 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YJR096W	P47137	282 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TOM7	P53507	60 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	DAD4	P69851	72 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	STP4	Q07351	490 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	POM33	Q12164	279 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	MPC2	P38857	129 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	PAU7	P39545	55 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	TDA4	P47153	279 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	ALG13	P53178	202 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YIP3	P53633	176 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YOL160W	Q08321	113 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		5	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	DAD2	P36162	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	RPB11	P38902	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	FIP1	P45976	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YGR026W	P53217	278 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	CSM4	Q08955	156 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	CCW12	Q12127	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	ELF1	P36053	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	MIX23	P38162	196 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	CAX4	P53223	239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	COX18	P53239	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YDR215C	Q12240	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	ATG33	Q06485	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RUF23	RUF23	YBR013C	P38215	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MST28	P39552	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	SPI1	P40092	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	KEG1	P43614	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MST27	P53176	234 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	TIM22	Q12328	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	CUP2	P15315	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	DUT1	P33317	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YHR022C	P38763	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	LCB3	P47013	409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MDM10	P18409	493 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YMR141C	P40211	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	DIA1	P54005	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YDR274C	P87283	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MRPS8	Q03799	155 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	GTO3	Q04806	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YPR013C	Q12145	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	PRM7	Q12459	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	CYC7	P00045	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	FZF1	P32805	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YBR090C	P38253	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YHR140W	P38842	239 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	HUA1	P40325	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YCH1	P42937	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YGL118C	P53132	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YDR366C	P87287	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YMR244W	Q04018	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MED7	Q08278	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	COA6	Q3E846	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	VAR1	P02381	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MIG1	P27705	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YER135C	P40082	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	SIM1	P40472	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	MIC26	P50087	233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	CYT2	Q00873	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	ARL3	Q02804	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	GPI19	Q04082	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	ZRT1	P32804	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	PAM17	P36147	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	GET2	P40056	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	AGE2	P40529	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YGR149W	P48236	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RUF23	RUF23	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RUF23	RUF23	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RUF23	RUF23	SSS1	P35179	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUF23	RUF23	YKL069W	P36088	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RUF23	RUF23	MRPL28	P36527	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.6 ms