RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618318.1

RPRD1B-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-208ENST00000618318 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RUBCNQ92622 972 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 DPF3Q92784 378 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 LPPQ93052 612 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 LRCH3Q96II8 777 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SENP8Q96LD8 212 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 HSFY1Q96LI6 401 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ZFP42Q96MM3 310 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 MIOSQ9NXC5 875 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CDH9Q9ULB4 789 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 COG5Q9UP83 839 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.33□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ENPP3O14638 875 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 GABRDO14764 452 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ZNF185O15231 689 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PSTPIP1O43586 416 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 MGEA5O60502 916 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RNF8O76064 485 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 POMCP01189 267 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CALCAP01258 141 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ALDH2P05091 517 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PDGFRBP09619 1106 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TYMPP19971 482 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 GJA8P48165 433 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PSEN1P49768 467 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 DNA2P51530 1060 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CLCNKBP51801 687 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 BCAT1P54687 386 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PTP4A2Q12974 167 aa8.32□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.32□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 TWNKQ96RR1 684 aa8.32□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 HIPK3Q9H422 1215 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ST7Q9NRC1 585 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 L1RE1Q9UN81 338 aa8.32□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CITO14578 2027 aa8.32□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PPEF2O14830 753 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SPTLC1O15269 473 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 EFCAB14O75071 495 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 CYP11A1P05108 521 aa8.31□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 CXCR5P32302 372 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 BRD3Q15059 726 aa8.31□□□□□ -1.08
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RPRD1B-208ENST00000618318 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 LRRC38Q5VT99 294 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 WSCD1Q658N2 575 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 TMEM110Q86TL2 294 aa8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
RPRD1B-208ENST00000618318 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.31□□□□□ -1.08
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