RNA–Protein interactions for RNA: YPR173C

VPS4, Transcript of AAA-ATPase involved in multivesicular body (MVB) protein sorting, yeast

Gene VPS4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VPS4	YPR173C	LIP2	Q06005	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	MRS3	P10566	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	YBR090C	P38253	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	YAR068W	P39564	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RAF1	Q06891	181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RKI1	Q12189	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VPS4	YPR173C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ANB1	P19211	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YPS6	P40583	537 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	BRP1	P53194	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YNR071C	P53757	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MSC3	Q05812	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	POS5	Q06892	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ATO3	Q12359	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YLR302C	O13544	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	PRY2	P36110	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YDL183C	P48569	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YGR017W	P53210	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YPL257W	Q08974	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	CYC3	P06182	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MRPS5	P33759	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MRPL39	P36533	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ECO1	P43605	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	SDS23	P53172	527 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YML079W	Q03629	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YHP1	Q04116	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	FIT2	Q08906	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	PAI3	P01094	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YOX1	P34161	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YPT10	P38146	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	BDH1	P39714	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MRX11	Q03079	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	BET5	Q03630	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	DPP1	Q05521	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RFM1	Q12192	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MRS1	P07266	363 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MDM10	P18409	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	CSH1	P38287	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YHL044W	P38727	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	PAU7	P39545	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YER084W	P40057	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	VPS71	Q03433	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	RAV2	Q03956	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	MTC6	P38849	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YIL012W	P40551	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	GON7	P46984	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	CAB4	P53332	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ATG4	P53867	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	ATG39	Q06159	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	DAP1	Q12091	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VPS4	YPR173C	FZF1	P32805	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	YJL163C	P46996	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	TOM7	P53507	60 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	ATP10	P18496	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	YPS1	P32329	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	SFT2	P38166	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VPS4	YPR173C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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