RNA–Protein interactions for RNA: YPR074C

TKL1, Transcript of Transketolase, yeast

Gene TKL1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TKL1	YPR074C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	YCR085W	P25650	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	AHT1	P29589	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	PEX2	P32800	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	GGC1	P38988	300 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	YIL169C	P40442	995 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	EMC4	P53073	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	YGR050C	P53231	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	YNL234W	P53857	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TKL1	YPR074C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	MIX23	P38162	196 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	PHO89	P38361	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	PCL5	P38794	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	IRC22	P40006	225 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	FLX1	P40464	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RIM8	P53179	542 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	GRX5	Q02784	150 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	MSA1	Q08471	629 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	ERV29	P53337	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	LDB16	P25587	256 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	SMP1	P38128	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	ATX1	P38636	73 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YGL193C	P53097	103 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	SDS23	P53172	527 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YGR018C	P53211	109 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YLR281C	Q05863	155 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	JID1	Q12350	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	GPX2	P38143	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	TIM17	P39515	158 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	SIM1	P40472	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	DFG10	P40526	253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	KNH1	P50112	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	SPS100	P13130	326 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	URA10	P30402	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	GPI19	Q04082	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	UBC4	P15731	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YCR050C	P25630	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YCR099C	P25657	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	MID2	P36027	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	EMC5	P40540	141 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	PCP1	P53259	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	ENV10	Q99382	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YNL198C	P40166	100 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	DSK2	P48510	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	MRP17	P28778	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	NMA2	P53204	395 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	EST3	Q03096	181 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	KRE1	P17260	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RIM2	P38127	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YNL320W	P42840	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YML053C	Q04978	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TKL1	YPR074C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	NRG2	P38082	220 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	YBR032W	P38223	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	SWM1	Q12379	170 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
TKL1	YPR074C	YPT10	P38146	199 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	PET8	P38921	284 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	ADD37	Q03233	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	IRC25	Q07951	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	GPI18	P38211	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	PAU15	P40585	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	TPC1	P53257	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	AVO2	Q04749	426 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	SVP26	P38869	228 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	NDD1	Q08887	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TKL1	YPR074C	DAD1	Q12248	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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