RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	YHL042W	P38729	150 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NRG1	Q03125	231 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YDL211C	Q12121	372 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RLM1	Q12224	676 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YOX1	P34161	385 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	GGC1	P38988	300 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TAX4	P47030	604 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	KNH1	P50112	268 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YGL230C	P53074	147 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPR096C	O13587	100 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YNL217W	P40152	326 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	OST2	P46964	130 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NPY1	P53164	384 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	AIM26	P32858	118 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YMR007W	Q03675	126 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	IRC21	Q04772	201 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	CYT1	P07143	309 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	VEL1	P53058	206 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	CPD1	P53314	239 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	HED1	Q03937	162 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YMR082C	Q04276	118 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	FLO10	P36170	1169 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SPC1	P46965	94 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	DFG5	Q05031	458 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PRM3	Q08931	133 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YPL264C	Q08980	353 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YLR149C	Q99296	730 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	IMG1	P25626	169 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	UTR5	P32630	166 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	VRP1	P37370	817 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YBL071C	P38185	102 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	ANS1	P38832	159 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	MID1	P41821	548 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YMR295C	Q03559	197 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TRP1	P00912	224 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	LDB16	P25587	256 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YKL070W	P36087	169 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SCW10	Q04951	389 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	STP3	Q05937	343 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	INO2	P26798	304 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	ALG14	P38242	237 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YIL163C	P40448	117 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SYM1	Q06563	197 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YOR292C	Q08743	309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TIM18	Q08749	192 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	JID1	Q12350	301 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	VPS63	O13549	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	BET1	P22804	142 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	FLO5	P38894	1075 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YJL028W	P47062	111 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	NCE101	Q02820	53 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	RTG1	P32607	177 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YND1	P40009	630 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PEX17	P40155	199 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SHU1	P38751	150 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YDL186W	P48568	277 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	CDH1	P53197	566 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SOR2	Q07786	357 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	MRS3	P10566	314 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YBL059W	P34224	193 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	PAM17	P36147	197 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	YBR209W	P38311	105 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	DSE2	P38844	325 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPO31	YOR116C	XBP1	P40489	647 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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