RNA–Protein interactions for RNA: YNL235C

YNL235C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL235C, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL235C	YNL235C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YNL235C	YNL235C	YLR031W	Q07978	186 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YNL235C	YNL235C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YNL235C	YNL235C	ARO7	P32178	256 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	SFK1	P35735	353 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	CAF4	P36130	643 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	CUP9	P41817	306 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YIP3	P53633	176 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	NRK1	P53915	240 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YPR114W	Q06107	315 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	PEX11	Q12462	236 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YKR041W	P36134	250 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	POG1	P40473	351 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	EMC4	P53073	190 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	RTC4	P53850	401 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YOL014W	Q08110	124 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	SHG1	P38337	142 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	SRP14	P38985	146 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YEL008W	P40001	126 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	GIM5	Q04493	163 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	RNH202	Q05635	350 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	FIT2	Q08906	153 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	COA3	Q3E7B2	85 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	SNF4	P12904	322 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	RAD51	P25454	400 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	MGT1	P26188	188 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	CYC2	P38909	366 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YLR460C	P54007	376 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	AIM34	Q03673	198 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YET3	Q07451	203 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	PAM17	P36147	197 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YEL073C	P39974	107 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YER121W	P40076	114 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	TDA4	P47153	279 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YNL033W	P53964	284 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	TIM8	P57744	87 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YDR391C	Q04170	232 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	LCL2	Q08045	131 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	AHC2	P25649	128 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	UBC8	P28263	218 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	CLG1	P35190	452 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	FMP23	P38231	175 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	YHL037C	P38733	133 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	NVJ1	P38881	321 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	SHH4	Q06236	168 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YNL235C	YNL235C	TIR1	P10863	254 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FIG1	P38224	298 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	RPS27B	P38711	82 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YFL019C	P43576	117 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SOL1	P50278	321 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	JAC1	P53193	184 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YNL140C	P53910	189 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	VPS71	Q03433	280 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YMR253C	Q04835	414 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	NAT3	Q06504	195 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FYV12	Q08559	129 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YCR023C	P25351	611 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	CPR5	P35176	225 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	FMP32	P43557	207 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	SBH1	P52870	82 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	PGA1	P53896	198 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GRX5	Q02784	150 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GPI17	Q04080	534 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	LDB18	Q07887	179 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	DGK1	Q12382	290 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	GTT2	Q12390	233 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	VPS51	P36116	164 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YNL235C	YNL235C	CSH1	P38287	376 aa		0.88	□□□□□ -2.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.2 ms