RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	DYN2	Q02647	92 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YDR209C	Q03480	137 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YPR071W	Q12346	211 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	HMRA1	P0CY11	126 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	CMC1	P36064	111 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SAS2	P40963	338 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	FHN1	P53279	174 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	AGE1	Q04412	482 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	VMA3	P25515	160 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	REC104	P33323	182 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YPT10	P38146	199 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	SNF11	P38956	169 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	PHS1	P40857	217 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YNL092W	P53934	400 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	YHP1	Q04116	353 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RRP5	YMR229C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	2.84	□□□□□ -1.95	not detected
RRP5	YMR229C	CPT1	P17898	393 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	AGA2	P32781	87 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	SWD3	P38123	315 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	BNS1	P50084	137 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YNR040W	P53736	256 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	EMP70	P32802	667 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBL059W	P34224	193 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	GLO1	P50107	326 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGL235W	P53071	178 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ERF2	Q06551	359 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PAU23	Q07987	124 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PAU17	Q12370	124 aa		2.84	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ISF1	P32488	338 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGR039W	P53225	103 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	UPS3	Q04006	179 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPL264C	Q08980	353 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YCR023C	P25351	611 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MRPS5	P33759	307 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PAU16	P35994	123 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBL071C	P38185	102 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ALG13	P53178	202 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MSN1	P22148	382 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MLF3	P32047	452 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	RPB7	P34087	171 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPL073C	P40323	161 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	OCA2	P53949	197 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YNL046W	P53956	172 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	HPA2	Q06592	156 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PRR2	Q12310	699 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PRM3	Q08931	133 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YLR122C	Q12312	125 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	VPS63	O13549	108 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	MXR2	P25566	168 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBR144C	P34215	104 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YHR173C	P38864	112 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	NCE103	P53615	221 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YMR181C	Q03231	154 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	IZH3	Q07959	543 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPL261C	Q08976	102 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	FLO9	P39712	1322 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YRF1-6	P53819	1859 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	PGU1	P47180	361 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	DSK2	P48510	373 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	TOS8	P53147	276 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	IZH1	Q03419	316 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YOR292C	Q08743	309 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	SET6	Q12529	373 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YFL068W	P0CX99	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	ICS2	P38284	255 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	SCO1	P23833	295 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YBR209W	P38311	105 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
RRP5	YMR229C	HUA1	P40325	198 aa		2.81	□□□□□ -1.96

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