RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeastyeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHK8YHR048W TIM21P53220 239 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W IZH3Q07959 543 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YPL162CQ12042 273 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W CNB1P25296 175 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W UTR5P32630 166 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YBR144CP34215 104 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W LSM2P38203 95 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W IMP2P46972 177 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W DAD3P69850 94 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W ERV2Q12284 196 aa5.13□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W RPB3P16370 318 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W PHD1P36093 366 aa5.12□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W SNU13P39990 126 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W GPI2P46961 280 aa5.12□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YMR181CQ03231 154 aa5.12□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W FIP1P45976 327 aa5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W APS2Q00381 147 aa5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W SNO1Q03144 224 aa5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W IZH1Q03419 316 aa5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W GEP3Q08622 556 aa5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W HTB2P02294 131 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MBB1P39534 108 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MOG1P47123 218 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MGA1P53050 456 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W ATP19P81451 68 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W ATG39Q06159 398 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YOR105WQ08504 108 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W DCN1Q12395 269 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W TY1A-DR3Q12441 440 aa5.1□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W FMP49A0A023PZB3 126 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YHR212W-AP0CX91 67 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W COQ3P27680 312 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YPT10P38146 199 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MPC2P38857 129 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W BNS1P50084 137 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YGL185CP53100 379 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W HHO1P53551 258 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W FYV6P53913 173 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W YML108WQ03759 105 aa5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
YHK8YHR048W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W AME1P38313 324 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W PAU15P40585 124 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W AIM24P47127 394 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W TDA4P47153 279 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W TRI1Q05024 226 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W NAT3Q06504 195 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YLR118CQ12354 227 aa5.08□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W POF1P25576 258 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data5.07□□□□□ -1.6not detected
YHK8YHR048W GLE2P40066 365 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YDL183CP48569 320 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W ALG13P53178 202 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W CAX4P53223 239 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YIP3P53633 176 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W RAV2Q03956 351 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W MET32Q12041 191 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YPR063CQ12160 140 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W DAD1Q12248 94 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YOP1Q12402 180 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YLR302CO13544 120 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W IRC22P40006 225 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YIL163CP40448 117 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W AGE2P40529 298 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W VMA21P41806 77 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W COX16P47081 118 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W TOM7P53507 60 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W LAS17Q12446 633 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W TMA17Q12513 150 aa5.07□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W TIR1P10863 254 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W CPT1P17898 393 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W PRE9P23638 258 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W MIG1P27705 504 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W SRP21P32342 167 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W NTF2P33331 125 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W MST28P39552 234 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W HIT1P46973 164 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W MST27P53176 234 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W DAD4P69851 72 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YOL160WQ08321 113 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa5.06□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W ECM33P38248 429 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YJR096WP47137 282 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W COX18P53239 316 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W UPS3Q04006 179 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W STP4Q07351 490 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YOR011W-AQ3E807 68 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YLR342W-AQ3E810 57 aa5.05□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W HMRA1P0CY11 126 aa5.04□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W YGL010WP25338 174 aa5.04□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W QRI5P32344 111 aa5.04□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W SDH4P37298 181 aa5.04□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W GTT1P40582 234 aa5.04□□□□□ -1.6
YHK8YHR048W DAN1P47178 298 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.2 ms