RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C RNH202Q05635 350 aa4.87□□□□□ -1.63
SHO1YER118C YSP2Q06681 1438 aa4.87□□□□□ -1.63
SHO1YER118C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SHO1YER118C ANB1P19211 157 aa4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C SPC25P40014 221 aa4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C SMD3P43321 101 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C ANT1Q06497 328 aa4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C HUT1Q12520 339 aa4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C KTI11Q3E840 82 aa4.86□□□□□ -1.63
SHO1YER118C DDR48P18899 430 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C CUP9P41817 306 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C YFR045WP43617 309 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C PAC10P48363 199 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C YLR042CQ07990 161 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C RTR2Q12378 196 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C SAS5Q99314 248 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C MMS1Q06211 1407 aa4.85□□□□□ -1.63
SHO1YER118C RPB11P38902 120 aa4.84□□□□□ -1.63
SHO1YER118C MPC3P53311 146 aa4.84□□□□□ -1.63
SHO1YER118C YMR295CQ03559 197 aa4.84□□□□□ -1.63
SHO1YER118C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data4.84□□□□□ -1.63not detected
SHO1YER118C IQG1Q12280 1495 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C VAR1P02381 398 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C MRS4P23500 304 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C MOB1P40484 314 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C PHS1P40857 217 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YOR268CQ08734 132 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C BUD3P25558 1636 aa4.83□□□□□ -1.64
SHO1YER118C MSW1P04803 379 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C HIS3P06633 220 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YER135CP40082 130 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YGL230CP53074 147 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YNR064CP53750 290 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C SHH3Q04487 196 aa4.82□□□□□ -1.64
SHO1YER118C LTE1P07866 1435 aa4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C RPS19AP07280 144 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C MID2P36027 376 aa4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C RRT1P38192 103 aa4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C EAF6P47128 113 aa4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa4.81□□□□□ -1.64
SHO1YER118C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C GPA2P10823 449 aa4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C NOP1P15646 327 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YPI1P43587 155 aa4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C RRT7Q07829 113 aa4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C GCN2P15442 1659 aa4.8□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YKR032WP36127 104 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C SFT2P38166 215 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YEL073CP39974 107 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C RIO2P40160 425 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C MPM1P40364 252 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C GAT4P40569 121 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C DAD3P69850 94 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C LIP1Q03579 150 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C OCA6Q12454 224 aa4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C DDP1Q99321 188 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SHO1YER118C SPG1P50088 95 aa4.78□□□□□ -1.64
SHO1YER118C DOC1P53068 250 aa4.78□□□□□ -1.64
SHO1YER118C HAP2P06774 265 aa4.77□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YCR050CP25630 102 aa4.77□□□□□ -1.65
SHO1YER118C PAM17P36147 197 aa4.77□□□□□ -1.65
SHO1YER118C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YHR180WP38868 163 aa4.76□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YNL217WP40152 326 aa4.76□□□□□ -1.65
SHO1YER118C HAL1Q01766 294 aa4.76□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YOR381W-AQ3E804 55 aa4.76□□□□□ -1.65
SHO1YER118C MDH2P22133 377 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C FZF1P32805 299 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YGL260WP53056 76 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C SAY1P53324 424 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C RIM9Q04734 239 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C PIN3Q06449 215 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C ATG10Q07879 167 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YPR063CQ12160 140 aa4.75□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YOL162WP0CF19 215 aa4.74□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YAR029WP39549 74 aa4.74□□□□□ -1.65
SHO1YER118C CSI2Q08054 341 aa4.74□□□□□ -1.65
SHO1YER118C SDH4P37298 181 aa4.73□□□□□ -1.65
SHO1YER118C GAA1P39012 614 aa4.73□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YMR252CQ04814 134 aa4.73□□□□□ -1.65
SHO1YER118C RAS2P01120 322 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YET1P35723 206 aa4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C DIE2P50076 525 aa4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C IRC23Q08416 157 aa4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C SCS22Q6Q595 175 aa4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C BNI1P41832 1953 aa4.72□□□□□ -1.65
SHO1YER118C DOP1Q03921 1698 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data4.71□□□□□ -1.66not detected
SHO1YER118C YBR090CP38253 122 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C TVP23P38962 199 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YFL012WP43580 148 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C DML1Q03652 475 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C YOR093CQ12275 1648 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C PDR11P40550 1411 aa4.71□□□□□ -1.66
SHO1YER118C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C SEC59P20048 519 aa4.7□□□□□ -1.66
SHO1YER118C MRPL15P36523 253 aa4.7□□□□□ -1.66
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