RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	SCW10	Q04951	389 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	PPT2	Q12036	173 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	PAC10	P48363	199 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	RSM27	P53305	110 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	BUD25	P85052	153 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	ATO3	Q12359	275 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	SWD3	P38123	315 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	TIM9	O74700	87 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	COX10	P21592	462 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	RTR2	Q12378	196 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	ODC2	Q99297	307 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	TOR1	P35169	2470 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	SPS2	P08459	502 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	AHT1	P29589	182 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
SYF1	YDR416W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YHR125W	P38831	101 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	DSK2	P48510	373 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YDR274C	P87283	123 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	EST3	Q03096	181 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	GAL83	Q04739	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	FYV12	Q08559	129 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YKR005C	Q02203	525 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	YDR102C	Q03864	110 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	RNH202	Q05635	350 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	YDR416W	FLO11	P08640	1367 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	VAR1	P02381	398 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	HIS3	P06633	220 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ANB1	P19211	157 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YOR062C	P36025	268 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ETR1	P38071	380 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ECM34	P38728	170 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MOB1	P40484	314 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	TVP18	Q04767	167 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	COX4	P04037	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	GEP7	P53171	287 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YML122C	Q03207	126 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SYM1	Q06563	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	UMP1	P38293	148 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YNR062C	P53748	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ELC1	Q03071	99 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
SYF1	YDR416W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RPB11	P38902	120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YEL028W	P39989	153 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	HUT1	Q12520	339 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	CTR2	P38865	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YER188W	P40103	239 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ECO1	P43605	281 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SBH1	P52870	82 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ANT1	Q06497	328 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	ATP20	Q12233	115 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RAD6	P06104	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RAD10	P06838	210 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	EMC4	P53073	190 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	RIF1	P29539	1916 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	DAD3	P69850	94 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MYO1	P08964	1928 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MRS4	P23500	304 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YBR242W	P38331	238 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	KRE9	P39005	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SPC25	P40014	221 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YER135C	P40082	130 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	PHS1	P40857	217 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YGL230C	P53074	147 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YGR026W	P53217	278 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	OCA6	Q12454	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	FAB1	P34756	2278 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	HAP2	P06774	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	DML1	Q03652	475 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	GPA2	P10823	449 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MPM1	P40364	252 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	CUP9	P41817	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YMR295C	Q03559	197 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SYF1	YDR416W	SFT2	P38166	215 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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