RNA–Protein interactions for RNA: YML061C

PIF1, Transcript of DNA helicase, potent G-quadruplex DNA binder/unwinder, yeast

Gene PIF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIF1	YML061C	YDL180W	Q12301	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	MRP10	O75012	95 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	CYC3	P06182	269 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	YKL075C	P36083	450 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	IZH2	Q12442	317 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PIF1	YML061C	MRP49	P32388	137 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YIL029C	P40538	142 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PCP1	P53259	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	FIT1	Q04433	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ATG39	Q06159	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PEX4	P29340	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SDH4	P37298	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MIC26	P50087	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	HHT1	P61830	136 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PRR2	Q12310	699 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YBR144C	P34215	104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PRY2	P36110	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	GAT2	P40209	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	GTT1	P40582	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MMS2	P53152	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	GEP7	P53171	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RCE1	Q03530	315 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	FCY2	P17064	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ATG15	P25641	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MCH1	Q07376	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ATG40	Q99325	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	HUA1	P40325	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	UBC13	P52490	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	LOA1	Q06508	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	CTR3	Q06686	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MED7	Q08278	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ISU2	Q12056	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	VAR1	P02381	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	STE4	P18851	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SEC59	P20048	519 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PIN3	Q06449	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RFM1	Q12192	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	COQ3	P27680	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PDR17	P53844	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YMR007W	Q03675	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ERV2	Q12284	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YOS1	Q3E834	85 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MRS3	P10566	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SSS1	P35179	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SPC25	P40014	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	HAC1	P41546	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YFL015C	P43578	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ATG27	P46989	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RTG1	P32607	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PEX7	P39108	375 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	RPL39	P04650	51 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	AHT1	P29589	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SCM4	P32564	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YPT53	P36019	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MOH1	P38191	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	XBP1	P40489	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	DFG10	P40526	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	GON7	P46984	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YGR050C	P53231	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SOR2	Q07786	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YOR292C	Q08743	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	LAS17	Q12446	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	POP5	P28005	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	CLB6	P32943	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MRPL39	P36533	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	SIP18	P50263	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	PAU4	P53427	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YHP1	Q04116	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	TVP18	Q04767	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YMR254C	Q04838	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PIF1	YML061C	MRPL28	P36527	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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