RNA–Protein interactions for RNA: YHR196W

UTP9, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP9, Length 1,728 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP9	YHR196W	EMI1	Q04406	187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	UPS1	Q05776	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	MCP1	Q12106	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SHE1	P38200	338 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YFL019C	P43576	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	WSC2	P53832	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	UBC5	P15732	148 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SDH4	P37298	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	GEP7	P53171	287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	TRP1	P00912	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	TOD6	P34219	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YHR130C	P38834	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	PHS1	P40857	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YJL028W	P47062	111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	EMC4	P53073	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	OSH6	Q02201	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
UTP9	YHR196W	ECM31	P38122	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	GAA1	P39012	614 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YER188W	P40103	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	EST3	Q03096	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	OM14	P38325	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	TEM1	P38987	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YAR029W	P39549	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	MPM1	P40364	252 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	NCA3	P46955	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	MRS4	P23500	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	VMA11	P32842	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	MSA2	P36157	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SFT2	P38166	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YER134C	P40081	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SYS1	P41544	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	CCH1	P50077	2039 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	CDC43	P18898	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	HOT13	P36078	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	SPC25	P40014	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	GTT1	P40582	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
UTP9	YHR196W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	PGU1	P47180	361 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	BNS1	P50084	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ATP15	P21306	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
UTP9	YHR196W	GAT4	P40569	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	PAM16	P42949	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	KEI1	Q06346	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	SLD7	Q08457	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ATG5	Q12380	294 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.52	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YIL059C	P40520	121 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ATG18	P43601	500 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ANT1	Q06497	328 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	AYT1	Q12226	474 aa		4.51	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	RAD6	P06104	172 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	COX10	P21592	462 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YAR068W	P39564	161 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	CRH1	P53301	507 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	RCE1	Q03530	315 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ATX2	Q12067	313 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	JID1	Q12350	301 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	ATO3	Q12359	275 aa		4.5	□□□□□ -1.69
UTP9	YHR196W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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