RNA–Protein interactions for RNA: YFL004W

VTC2, Transcript of Subunit of vacuolar transporter chaperone (VTC) complex, yeast

Gene VTC2, Length 2,487 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VTC2	YFL004W	SAG1	P20840	650 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	ATX1	P38636	73 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YAR068W	P39564	161 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	COX15	P40086	486 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YIL163C	P40448	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	TDA4	P47153	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CPD1	P53314	239 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	BET5	Q03630	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	COX10	P21592	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CMC1	P36064	111 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YAL037W	P39728	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	RPB8	P20436	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	WSC4	P38739	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YJL213W	P40896	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YJR096W	P47137	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CUZ1	P53899	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	USV1	Q12132	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	MRS1	P07266	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	BRP1	P53194	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SUR7	P54003	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	DPP1	Q05521	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	QRI5	P32344	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	TOA2	P32774	122 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	OST2	P46964	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	TPC1	P53257	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	PAM18	Q07914	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	XYL2	Q07993	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	MCH4	Q08268	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YBR090C	P38253	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	TVP23	P38962	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SAS2	P40963	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	RLM1	Q12224	676 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	VAR1	P02381	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	MCH2	P36032	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	MOH1	P38191	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	DER1	P38307	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YNR071C	P53757	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SDH7	Q04401	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	MSI1	P13712	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	RPB7	P34087	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YCH1	P42937	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	BNA2	P47125	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	AYT1	Q12226	474 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	GAL7	P08431	366 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SRX1	P36077	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SNF11	P38956	169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CUP9	P41817	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YIP5	P53108	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CRZ1	P53968	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	LIP2	Q06005	328 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	DGA1	Q08650	418 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	JID1	Q12350	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	HEM4	P06174	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CPT1	P17898	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YPT10	P38146	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	CTK2	P46962	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	DSK2	P48510	373 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	SDS23	P53172	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YGR050C	P53231	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	ATG4	P53867	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	ERG8	P24521	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	FUB1	P25659	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	GCS1	P35197	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	GEP7	P53171	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
VTC2	YFL004W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	TGL2	P54857	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	MIX17	Q03667	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	MIM1	Q08176	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	MST28	P39552	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	ATG21	Q02887	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	GTO3	Q04806	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
VTC2	YFL004W	FIT3	Q08907	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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