RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SIP14410 1827 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RAD51CO43502 376 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 PRLRP16471 622 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 GUCY2DQ02846 1103 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 AMACRQ9UHK6 382 aa18.97■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 ASAP2O43150 1006 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 PSEN2P49810 448 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 C8orf74Q6P047 294 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 CDH23Q9H251 3354 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 TNNC2P02585 160 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RGS2P41220 211 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 ACCSLQ4AC99 568 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 MCOLN2Q8IZK6 566 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 KRIT1O00522 736 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 SPOPO43791 374 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 NSFP46459 744 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RAB27AP51159 221 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 GUCY1A3Q02108 690 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 KCTD16Q68DU8 428 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP14Q86W24 1093 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 C12orf29Q8N999 325 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 KIF12Q96FN5 646 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 GGA2Q9UJY4 613 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 INTUQ9ULD6 942 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.96■□□□□ 0.63
PDE4D-204ENST00000358923 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 HSF2BPO75031 334 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 FAM153BP0C7A2 387 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 PYGMP11217 842 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 FAM153CQ494X1 144 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 NIF3L1Q9GZT8 377 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 FAM153AQ9UHL3 310 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 MROH7Q68CQ1 1323 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 SCN1AP35498 2009 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ABCD1P33897 745 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 PTGISQ16647 500 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC142Q17RM4 750 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 APBA2Q99767 749 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 CYTH4Q9UIA0 394 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 NFU1Q9UMS0 254 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 GZMAP12544 262 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ANXA13P27216 316 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 SEC24CP53992 1094 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 NOMO3P69849 1222 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 WDTC1Q8N5D0 677 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 C3orf20Q8ND61 904 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ACAP3Q96P50 834 aa18.94■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 B4GALT4O60513 344 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 MYO1EQ12965 1108 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 NNTQ13423 1086 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ARMC3Q5W041 872 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 DENND1BQ6P3S1 775 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 CXorf38Q8TB03 319 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 RNF186Q9NXI6 227 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 C7orf31Q8N865 590 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 UBA3Q8TBC4 463 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM51Q9BSJ1 452 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 ANK1P16157 1881 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 TRPA1O75762 1119 aa18.93■□□□□ 0.62
PDE4D-204ENST00000358923 CYP1A2P05177 515 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms