RNA–Protein interactions for RNA: YGL171W

ROK1, Transcript of RNA-dependent ATPase, yeast

Gene ROK1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROK1	YGL171W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SNM1	P40993	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YFR054C	P43622	192 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	RPE1	P46969	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	UFD1	P53044	361 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YGR219W	P53307	113 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	BOR1	P53838	576 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FYV7	Q12247	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ATG5	Q12380	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FLO11	P08640	1367 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	NMT1	P14743	455 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SFC1	P33303	322 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TKL2	P33315	681 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SDH3	P33421	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YPT53	P36019	220 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FCY21	P40039	528 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TTI2	P47168	421 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SLM2	P53955	656 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	API2	Q04413	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	DGK1	Q12382	290 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR462W	O13556	202 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ZRT3	P34240	503 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	OM14	P38325	134 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YEL075C	P39972	122 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FIP1	P45976	327 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PGU1	P47180	361 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TIM13	P53299	105 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	HHO1	P53551	258 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YDR366C	P87287	132 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	AYR1	P40471	297 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	APS2	Q00381	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	VPS71	Q03433	280 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SYS1	P41544	203 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TDA4	P47153	279 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	XPT1	P47165	209 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SLD7	Q08457	257 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TIR1	P10863	254 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YCR043C	P25361	127 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	TEM1	P38987	245 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YGL118C	P53132	145 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YGR039W	P53225	103 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PBA1	Q05778	276 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PHO85	P17157	305 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SPT14	P32363	452 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	AVT2	P39981	480 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	CWC27	Q02770	301 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ECM19	Q06011	112 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	IRC25	Q07951	179 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	MCP1	Q12106	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FCY1	Q12178	158 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ATP5	P09457	212 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PHO13	P19881	312 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	BET1	P22804	142 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	HYM1	P32464	399 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	NSG1	P38837	291 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SER2	P42941	309 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YOL014W	Q08110	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	SPC3	Q12133	184 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	IES3	Q12345	250 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	PST1	Q12355	444 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ROK1	YGL171W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ROK1	YGL171W	DDI2	P0CH63	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ROK1	YGL171W	DDI3	P0CH64	225 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ROK1	YGL171W	CCA1	P21269	546 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ROK1	YGL171W	PTC1	P35182	281 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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