RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	AEP3	Q12089	606 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	FRE6	Q12473	712 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	QCR9	P22289	66 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ERV1	P27882	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	EMP70	P32802	667 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SOL3	P38858	249 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	AGX1	P43567	385 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YPS7	Q06325	596 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	WSC4	P38739	605 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YPI1	P43587	155 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	IGO1	P53897	168 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ORM2	Q06144	216 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ARR3	Q06598	404 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	GAL1	P04385	528 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	LAC1	P28496	418 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	HIT1	P46973	164 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YGL204C	P53089	101 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YNR040W	P53736	256 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SNF11	P38956	169 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	DOG1	P38774	246 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	APJ1	P53940	528 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MRX11	Q03079	207 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RKI1	Q12189	258 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YER134C	P40081	178 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YIL024C	P40543	189 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	VMA21	P41806	77 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	DUG3	P53871	357 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SPR6	Q01684	191 aa		4.25	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RPL39	P04650	51 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	AIM29	P36154	155 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YBL071C	P38185	102 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YGL118C	P53132	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	LST7	P53237	242 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	POS5	Q06892	414 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YBR197C	P38306	217 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YHR130C	P38834	111 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YEA4	P40004	342 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PIR5	P46999	287 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	TAD2	P47058	250 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ELC1	Q03071	99 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PMU1	P36069	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	GTT1	P40582	234 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	GWT1	P47026	490 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	FMP16	Q12497	93 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	THI4	P32318	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MRPL16	P38064	232 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SUR2	P38992	349 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PGU1	P47180	361 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ALG13	P53178	202 aa		4.24	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PET18	P25362	215 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	FHN1	P53279	174 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PMP3	P87284	55 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YDR366C	P87287	132 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
DNF2	YDR093W	PUT1	P09368	476 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ATP5	P09457	212 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YFR020W	P43600	232 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	GLO1	P50107	326 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ANT1	Q06497	328 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	PPT2	Q12036	173 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	OCH1	P31755	480 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	POG1	P40473	351 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YFR054C	P43622	192 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	TRS23	Q03784	219 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SHH3	Q04487	196 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	SYM1	Q06563	197 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	COA6	Q3E846	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	MXR2	P25566	168 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ISF1	P32488	338 aa		4.22	□□□□□ -1.73
DNF2	YDR093W	ALG14	P38242	237 aa		4.22	□□□□□ -1.73

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