RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ECM12	O13529	151 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	COX7	P10174	60 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPO12	P17123	173 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LAC1	P28496	418 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YET1	P35723	206 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CMC1	P36064	111 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MIX23	P38162	196 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RRT1	P38192	103 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	COX16	P47081	118 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YJR142W	P47173	342 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL159W	P53110	370 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	AAH1	P53909	347 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR209C	Q03648	457 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDR115W	Q04598	105 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR253C	Q04835	414 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DXO1	Q06349	442 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NAT3	Q06504	195 aa		0.19	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NFT1	P0CE68	1218 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PHO80	P20052	293 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ERG3	P32353	365 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRP49	P32388	137 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YKR045C	P36138	183 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FZO1	P38297	855 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL262W	P53054	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGR168C	P53293	376 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BIO4	P53630	237 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RGM1	Q00453	211 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NUP49	Q02199	472 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR027W	Q04371	470 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SDH7	Q04401	133 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DPP1	Q05521	289 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	THP1	Q08231	455 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HRT1	Q08273	121 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOR186W	Q08560	144 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FEX1	Q08913	375 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FEX2	Q08991	375 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	IES3	Q12345	250 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SAS5	Q99314	248 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	FCY2	P17064	533 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YER076C	P40049	302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YIL059C	P40520	121 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	LST8	P41318	303 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BRP1	P53194	125 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	COG5	P53951	403 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CSN9	Q03981	162 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VPS20	Q04272	221 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	VBA1	Q04301	562 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPC2	Q04969	178 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YET3	Q07451	203 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YDL241W	Q07738	123 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOL160W	Q08321	113 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	DCI1	Q08558	271 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YOR268C	Q08734	132 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	PRM4	Q12498	284 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	BOL1	Q3E793	110 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.18	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YLR302C	O13544	120 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RHO2	P06781	192 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CPT1	P17898	393 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ECT1	P33412	323 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MRPL3	P36516	390 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	YBR137W	P38276	179 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SVP26	P38869	228 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	MST28	P39552	234 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	SPI1	P40092	148 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	RPC10	P40422	70 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	CIN5	P40917	295 aa		0.17	□□□□□ -2.38
AI1	Q0050	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms