RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 PCIF1Q9H4Z3 704 aa28.77■■■□□ 2.2
ODC1-204ENST00000446285 MIA3Q5JRA6 1907 aa28.77■■■□□ 2.2
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA8IPA6NC78 632 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA8JA6NMD2 632 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 MOSPD3O75425 235 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 ITGB3P05106 788 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 FCARP24071 287 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.76■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.76■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa28.76■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 POTEHQ6S545 545 aa28.75■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 HPS3Q969F9 1004 aa28.74■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 PDE11AQ9HCR9 933 aa28.74■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa28.73■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 HSPBP1Q9NZL4 362 aa28.73■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa28.73■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 PSMC3P17980 439 aa28.72■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 MAGEA9P43362 315 aa28.72■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 CEP57L1Q8IYX8 460 aa28.72■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 IRF7Q92985 503 aa28.72■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 HS2ST1Q7LGA3 356 aa28.71■■■□□ 2.19
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ODC1-204ENST00000446285 TTC9BQ8N6N2 239 aa28.71■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.71■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 FAM200AQ8TCP9 573 aa28.71■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 ACBD6Q9BR61 282 aa28.71■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ODC1-204ENST00000446285 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
ODC1-204ENST00000446285 GFRA3O60609 400 aa28.7■■■□□ 2.18
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