RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 ELF1P32519 619 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 AP3M2P53677 418 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 MYL6P60660 151 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 OSTM1Q86WC4 334 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PGLYRP2Q96PD5 576 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TSG101Q99816 390 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 MAFFQ9ULX9 164 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.89■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.88■□□□□ 0.29
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ACTB-206ENST00000443528 C2CD4DB7Z1M9 353 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 GABRDO14764 452 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PSMA7O14818 248 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 IKBKBO14920 756 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CETN3O15182 167 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PHACTR2O75167 634 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 POU2F2P09086 479 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TRIM49P0CI25 452 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TRIM49CP0CI26 452 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PPP1R2P41236 205 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 LRRC63Q05C16 580 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ENPEPQ07075 957 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 BIRC3Q13489 604 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TRPC3Q13507 836 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 STIM1Q13586 685 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ZACNQ401N2 412 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SV2AQ7L0J3 742 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DPH6Q7L8W6 267 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 LRRTM3Q86VH5 581 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TMEM86AQ8N2M4 240 aa16.88■□□□□ 0.29
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ACTB-206ENST00000443528 PIDD1Q9HB75 910 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CLUHO75153 1309 aa16.88■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PRRG1O14668 218 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 HCRTO43612 131 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 KRT13P13646 458 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ATICP31939 592 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CDR1P51861 262 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 NTHL1P78549 312 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PPP3CAQ08209 521 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 NCOA4Q13772 614 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TTI2Q6NXR4 508 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TRIML1Q8N9V2 468 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SPATA18Q8TC71 538 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 USTQ9Y2C2 406 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 NR2E1Q9Y466 385 aa16.87■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 XYLBO75191 536 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 DUSP4Q13115 394 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 WDR72Q3MJ13 1102 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 RNF135Q8IUD6 432 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 GPT2Q8TD30 523 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 NELFBQ8WX92 580 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 MMS19Q96T76 1030 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 PKMYT1Q99640 499 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 ACBD6Q9BR61 282 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 POLIQ9UNA4 740 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 LRG1P02750 347 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 LMO2P25791 158 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 GCLMP48507 274 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 LHX1P48742 406 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 TWF1Q12792 350 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTB-206ENST00000443528 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.85■□□□□ 0.29
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