RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERLIN1O75477 346 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD4P01730 458 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHRNA1P02708 482 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX5P50542 639 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAMLD1Q13495 774 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF180Q86T96 592 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAET1EQ8TD07 263 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TWNKQ96RR1 684 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OGFRQ9NZT2 677 aa23.24■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS6KA5O75582 802 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD19P15391 556 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC1A1P43005 524 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD6Q96KE9 485 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOL6Q9BWW8 343 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARVAQ9NVD7 372 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMGXB4Q9UGU5 601 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIAA1257Q9ULG3 409 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.23■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPOPO43791 374 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP3A5P20815 502 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C8orf74Q6P047 294 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT35Q92764 455 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF39Q9H2S5 420 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP2Q9UGN5 583 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTTP42858 3142 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC188H7C350 402 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO1FO00160 1098 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP8B1O43520 1251 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VDRP11473 427 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTGISQ16647 500 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2CD6Q53TS8 623 aa23.22■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIRO00625 290 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPEF2O14830 753 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VEGFBP49765 207 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LCMT1Q9UIC8 334 aa23.21■■□□□ 1.31
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROSCO94903 275 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNPLA4P41247 253 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARCKSL1P49006 195 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDST1P52848 882 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACLYP53396 1101 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTK7Q13308 1070 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNGA2Q16280 664 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM7Q9C029 511 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLK14Q9P0G3 267 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR182O15218 404 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGGP02679 453 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTSHP09668 335 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITGA7Q13683 1181 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERICH1Q86X53 443 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF560Q96MR9 790 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STIM2Q9P246 746 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX9Q9Y5X1 595 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 O00370 1275 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRIT1O00522 736 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAN1A1P33908 653 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRMT2P55345 433 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAP1Q03518 808 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF6Q15052 776 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LONRF2Q1L5Z9 754 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGO2Q562F6 1265 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO47Q5MNV8 452 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HACE1Q8IYU2 909 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT12Q99456 494 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GDAP2Q9NXN4 497 aa23.19■■□□□ 1.3
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms